南海北部巴士海峡深海沉积物中细菌多样性分析.pdfVIP

热带海洋学报 JOURNALOFTROPICALOCEANOGRAPHY 2010年 第 29卷 第3期 ：41-46 南海北部巴士海峡深海沉积物中细菌多样性分析水 孙慧敏 一，戴世鲲 一，王广华 一，谢练武 一，李翔 (1．中国科学院海洋生物可持续利用重点实验室，广东 广州 510301；2．中科院研究生院，北京 100049) 摘要：从南海北部巴士海峡深海沉积物中提取到高质量的总DNA，通过 TA克隆构建 了含有23个可操作分类单元 (OTU)的16SrRNA基因文库，选择各OTU中代表性克隆子进行测序与系统发育分析，结果表明，南海北部巴士海 峡深海沉积物 中细菌在系统进化树 中至少分属于 9个类群：其中放线菌 Actinobacteria，变形细菌 Proteobaeteria， 和浮霉菌Planctomycetes为优势种；其他细菌如疣微菌 Verrucomicrobia，鞘脂杆菌Sphingobacteria，硝化螺旋菌门 (Nitrospira)，绿弯菌Chloroflexi，厚壁菌Firmicute，酸杆菌Acidobacteria等为非优势种群；另外有两个克隆子属于 未知种群 。在所获得的23个代表克隆子序列中，有 11个序列与已知细菌的同源性 ≤95％，占到了所有序列的4