基于图像微阵列生物芯片分析.pdfVIP

25卷6期 中 国 生物 医学 工程学报 V01．25No．6 2006年12月 ChineseJournalBiomedical December2006 of Engineering 基于图像的微阵列生物芯片分析 段会龙” 邓 宁 (浙江大学生物医学工程与仪器科学学院，教育部生物医学工程重点实验室，杭州 310027) 摘要：利用生物芯片的高通量特性，系统地研究生物体基因和蛋白质表达及其相互作用，在最近十几年迅速发 展。以图像为基础的生物芯片分析是生物芯片技术的重要组成部分，对其方法进行研究已成为当前的热点之一。 目前很多针对生物芯片的分析方法不断涌现，这些方法涉及网格定位、靶点分割、数据提取和表达、几何校正、噪声 消除等生物芯片分析子过程。本研究对以上各类分析方法进行了综述，分析了各类方法的不同应用，比较了多种 算法的分析结果，并提出当前在生物芯片分析研究领域需要解决的关键问题。 关键词：生物芯片；图像分割；自动网格定位；投影算法；表达分析 A on SurveyImage-basedMicroarrayAnalysis DUAN Hui—Long。DENGNing Biomedical andInstrument Biomedical (Collegeof Engtneering Science，The研Laboratoryof Engineering in 310027) MinistryofEducation，ZhejiangUniversity，Hangzhou are toolsforthe of and Abstract：Microarraysrevolutionaryhigh·throughput studygene proteomicsexpressions．7IMs hasbeen advancedinrecent isan of technology rapidly analysis importantaspectmieroarray years．Image—based hot canhavea on andthereforebecomestheresearch experiments，whichpotentiallylargeimpactsubsequentanalyses of methodsusedOil datahavebeen spot．Numbersanalysis microarray issued，including extractionand andSOon．Inthis classesof based correction，noise paper，all image expression，image removing