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第 39卷 增刊 I 东 南 大 学 学报 ( 自然 科 学 版 ) V o l. 39 Sup I
2009年 9 月 JOU RNAL O F SOU TH EA ST UN IV ER S ITY (N atu ra l Sc ience Ed ition ) S ep t. 2009
一种基于模糊神经网络的 ncRNA 基因预测方法
宋丹丹 邓志东
(清华大学智能技术与系统国家重点实验室 , 北京 100084)
(清华信息科学与技术国家实验室 , 北京 100084)
(清华大学计算机科学与技术系 , 北京 100084)
摘要 : 提出了一种基于模糊神经网络的 ncRNA 基因预测方法. 该方法由预处理 、具有结构学习
的模糊神经网络预测器 、后处理 3 个部分组成. 预处理模块将比对后的输入序列进行滑动窗处
理 , 并顺序提取有效的特征信息. 模糊神经网络预测器采用了基于 Takag iSugeno 模型的 5层模
糊神经网络结构 ,通过输入层 、模糊化层 、点火强度层 、归一化点火强度层 、输出层的计算 , 得到预
测结果; 并进一步给出了一种模糊神经网络的结构学习算法 , 可有效地降低参数空间的维度 , 提
高计算效率 , 并避免过学习情况的产生. 后处理过程可对有交叠的预测结果进行拼接. 实验结果
表明,较之其他预测工具 , 本方法的 ncRN A 基因预测精度有所提高.
关键词 : ncRN A 基因预测; 模糊神经网络; 结构学习
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中图分类号 : U 459. 2 文献标识码 : A 文章编号 : 100 1 - 0505 2009 增刊 I 0 13907
Novel ncRNA gene prediction method based on fuzzy neural network
S ong D andan D eng Zh idong
( S tate Key L aboratory of In te lligen t Techno logy and Sy stem s, Tsinghua U n iversity, B eij ing 100084, C h ina)
( Tsinghua N ationa l L aboratory for Inform ation Sc ience and Techno logy, Tsinghua U n iversity, B eij ing 100084, C h ina)
(D ep artm en t of C om p u ter Science and Techno logy, Tsinghua U n iversity, B e ij ing 100084, Ch ina)
A b stract: A n effec tive com p u tationa l app roach fo r nove l non cod in
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