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第30 卷第1 期 食 品 与生 物 技 术学 报 Vol. 30 No. 1
2011 年 1 月 Journal of Food Science and Biotechnology Jan. 20 11
: 1673- 1689( 20 11) 01-0095-06
基于图聚类的蛋白质相互作用网络功能模块探测
1 2 2
梅娟 , 何胜 , 李炜疆
( 1. 无锡城市职业技术学院 电子信息工程系, 江苏无锡214 153; 2. 江南大学生物工程学院, 江
苏无锡2 14122)
: 作者采用了基于模块性的图聚类算 来探测蛋白质相互作用网络中的集团, 在具有 2 6 17
个节点11 855 个相互作用的酵母蛋白质相互作用网络中探测出177 个集团, 同时采用慕尼黑信息
中心( M unich Information Center , M IPS) 的层次功能注释对其进行了注释, 并且验证得到的集团
的确是内部连接紧密的子图
: 蛋白质 互作用网络; 模块性; 聚类; 功能模块
: Q 811. 4 : A
Detection of Communities in the Yeast Protein-Protein Interaction
Network Based on Gra h Clustering
1 2 2
M EI Juan , HE Shen , LI We-i jian
( 1. Depart ment of Electronic and Information T echnolo y , Wux i Cit y Colle e of Vocational T echnolo y , Wux i
214153, China; 2. School of Biotechnolo y , Jian nan Universit y, Wuxi 214 122, China)
Abstract:Interaction detection methods can led to the discovery of thousands of protein-protein
interactions, and discernin relevance w ithin lar e-scale data sets is important for bioinfor mation.
As an important means for know led e discovery , raph clusterin attracts much attention in
analy sis of protein-protein interaction netw or ks. Here, a modularity-based method w as used to
find communities of pr otein-protein interaction netw or ks. U sin this method, 177 communities
w er e detected from a netw ork involvin 11, 855 inter actions amo
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