基于粗粒化模型对有机溶剂分子动力学模拟.pdfVIP

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2017-08-30 发布于安徽
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基于粗粒化模型对有机溶剂分子动力学模拟.pdf

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物理化学学报(Wuli Huaxue Xuebao) August Acta Phys. -Chim. Sin . 2011, 27 (8), 1839-1846 1839 [Article] 基于粗粒化模型对有机溶剂的分子动力学模拟许佩军1 唐媛媛1,2 张静1 张知博1 王昆1 邵颖3 沈虎峻2,* 毛英臣1,* 1 2 ( 辽宁师范大学物理与电子技术学院, 辽宁大连116029; 中国科学院大连化学物理研究所, 辽宁大连116023; 3 大连海事大学物理系, 辽宁大连116026) 摘要: 在基于Boltzmann 分布对四种基本构象进行Monte Carlo 取样后, 通过与全原子模型的范德华势比较得到了Gay-Berne (GB)参数. 又在对用量化计算得到的分子体系的电势进行电荷、偶极矩和四极矩的拟合后, 得到了电多极展开势(EMP)参数. 利用得到的粗粒化参数, 基于粗粒化模型, 对CHCl 及四氢呋喃(THF)两种有 3 机溶剂进行了分子动力学模拟(MDS), 并将结果同全原子模拟进行了比较. 计算结果表明用粗粒化模型从整体上能重复全原子模型的模拟结果, 但在某些细节的计算与全原子模型有偏差, 其原因可能是目前工作仅考虑了单位点情况, 为此今后在对具有复杂结构的分子进行粗粒化模拟时还应考虑合理放置及增加相互作用位点. 关键词: 粗粒化模型; Gay-Berne 势; 电多极展开势; 径向分布函数; 分子动力学模拟中图分类号: O645; O641 Molecular Dynamics Simulation of Organic Solvents Based on the Coarse-Grained Model XU Pei-Jun1 TANG Yuan-Yuan1,2 ZHANG Jing1 ZHANG Zhi-Bo1 WANG Kun1 SHAO Ying3 SHEN Hu-Jun2,* MAO Ying-Chen1,* 1 ( School of Physics and Electronic Technology, Liaoning Normal University, Dalian 116029, Liaoning Province, P. R. China; 2Dalian Institute of Chemical Physics, Chinese Academy of Sciences, Dalian 116023, Liaoning Province, P. R. China; 3Department of Physics, Dalian Mari