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生物化学与生物物理进展 Progress in Biochemistry and Biop hys ics 201 1, 38(1): 11~ 19 基于生物信息学方法发现潜在药物靶标* 刘伟 谢红卫** ( 国防科学技术大学机电工程与自动化学院自动控制系，长沙4 10073) 摘要 药物靶点通常是在代谢或信号通路中与特定疾病或病理状态有关的关键分子 通过绑定到特定活动区域抑制这个关键 分子进行药物设计 确定特定疾病有关的靶标分子是现代新药开发的基础 在药物靶标发现的过程中，生物信息学方法发挥 了不可替代的重要的作用，尤其适用于大规模多组学数据的分析 目 ，已涌现了许多与疾病相关的数据库资源，基于生物 网络特征、多基因芯片、蛋白质组、代谢组数据等建立了多种生物信息学方法发现潜在的药物靶标，并预测靶标可药性和药 物副作用 关键词 药物靶标，网络特征，基因芯片，蛋白质组学 学科分类号 Q61 DOI: 10.3724/SP.J.1206.2010.00251 药物靶标是指体内具有药效功能并能被药物作 疾病/ 正常组织 用的生物大分子，如某些蛋白质和核酸等 靶标基 础上的药物开发流程将组织作为一系列基因和通路 的集合，目标是发展一种能够影响一个基因或者分 子机制(即一个靶标) 的药物，治疗疾病引起的缺陷 基因组 转录组 蛋白质组 代谢组 同时尽可能地减少副作用 尽管实验技术取 了很 大进步，人们对于生物系统有了更深入的理解，药 物发现仍旧是个漫长的过程，新药研发昂贵、困难 生物信息学分析 并且低效 其中，药靶发现是非常重要的一个限速 步骤 功能研究 药靶筛选和功能研究是发现特异的高效、低毒 性药物的 提 靶标发现与确证的一般流程( 图1) 确定候选药物靶标 是：利用基因组学、蛋白质组学以及生物芯片技术 等获取疾病相关的生物分子信息，并进行生物信息 靶标验证 学分析，然后对相关的生物分子进行功能研究，以 确定候选药物作用靶标，针对候选药物作用靶标， Fig 1 Typical flow chart of drug target discovery 1 药物靶标发现的典型流程 设计小分子化合物，在分子、细胞和整体动物水平 上进行药理学研究，验证靶标的有效性 * 家自然科学基金, 常见的用于药靶发现的实验方法包括：微生物 家重点基础研究发展计划(973)(2006CB910803, 2006CB9 10706), 基因组学、差异蛋白质组学、核磁共振(NMR) 技 家高技术研究发展计划(863)(2006AA02A3 12), 家科技重大专项 术、细胞芯片技术、RNAi 技术、基因转染技术和 (2008ZX 10002-0 16, 2009ZX09301-002)和蛋白质组学 家重点实验 基因敲除动物等 随着组学数据的积累，仅凭实验 室课题(SKLP-Y2008 11)资助项目. 方法已经不能满足高通量大规模数据分析的需求 ** 通讯联系人. Tel: