花生微卫星标记研究进展.pdfVIP

植物学通报Chinese Bulletin of Botany2008, 25(3): 373380, . . 专题介绍 花生微卫星标记的研究进展 1 1 2 1* 李孟军,肖寒,卢金东,王兴军 1山东省农业科学院高新技术研究中心,山东省作物与畜禽品种改良生物技术重点实验室,济南 250100 2山东省农业科学院蔬菜研究所,济南 250100 摘要 近年来花生微卫星标记的开发取得了一定的进展,初步揭示了花生在DNA水平上的遗传多样性。花生微卫星标记的 开发途径主要包括通过构建小片段基因组文库开发基因组SSR标记,根据花生EST序列开发EST-SSR标记,根据豆科植物序 列信息和SSR标记开发花生SSR标记,将SSR标记与其它分子标记结合开发新的DNA标记,以及基于SSR核心序列开发ISSR 标记。花生微卫星标记主要应用于遗传多样性研究、遗传图谱与品种指纹图谱构建以及分子标记辅助育种等领域。本文综述 了花生SSR标记开发研究的进展及应用。 关键词 表达序列标签,花生,微卫星标记,简单序列重复 李孟军,肖寒,卢金东,王兴军 (2008).花生微卫星标记的研究进展.植物学通报25, 373380. 栽培花生(Arachis hypogaea L.)是异源四倍体 。微卫星中重复单位 (2n=4x=40, AABB),含有A和B 个基因组。2 现有 的数目存在高度变异,这些变异表现为微卫星数目的整 研究认为四倍体栽培种是由二倍体种A. duranensis (A 倍性变异或重复单位序列中的序列有可能不完全相同, genome)和A. ipaënsis (B genome)单一杂交后经染色 因而造成多个位点的多态性,称为简单序列长度多态性 体自发加倍而成(Kochert et al., 1996)。单一杂交起 。 源、多倍化引起的生殖隔离和少数育种亲本的使用以 SSR标记是目前最广泛使用的微卫星标记,与其它分子 及连续选择,使栽培花生基因组高度保守,遗传多样性非 标记相比, SSR标记具有以下优点: (1)数量丰富,覆盖 常有限(Young et al., 1996)。尽管栽培花生在形态性 整个基因组,揭示的多态性高; (2)具有多等位基因的特 状上存在广泛的分化,但这些形态多样性可能只是由少 性,提供的信息量高; (3)以孟德尔方式遗传,呈共显性; 数基因引起的(Kochert et al., 1991)。了解栽培花生和 (4)与RFLP、RAPD和AFLP等分子标记相比,具有方 野生花生的遗传多样性对花生种质的收集、保存和育 法简便和重复性好等优点。SSR标记的不足之处主要 种应用具有重要意义。 在于SSR座位突变率高,对变异反应非常敏感,易受趋 同变异引起的平行演化程度的影响,给物种间亲缘关系 微卫星(microsatellite)或称简单序列重复(simple 的评估带来误差。 sequence repeats, SSR)或短串联重复(short tandem 近年来,花生微卫星标记数量有了显著增加(Hop- repeats, STR)或可变数串联重复(variable number tan- dem repeat, VNTR),是指基因组中由2-6个核苷酸组 成的基本单位多次重复所构成的一段DNA序列。微卫 星分子标记主要有3种类型: SSR、ISSR(inter-simple 。已有研 究表明, SSR标记是在研究栽培花生遗传多样性、评 sequence repeat)和SAMPL(selective amplification of 收稿日期: 2007-