【论文】合成生物学必须直面的五项挑战.pdfVIP

生命科学 合成生物学必须直面的五项挑战 石 磊 ／编译 有关合成生物学的一些报道给人的感觉是：操纵生命 的能力似乎仅仅被想象力操控。或许 不久以后 ，研 究人 员可以对细胞进行 “编程”，从可再生来源 (Fenewab1esource)中生产 出 大量的生物燃料，或检测毒素的存在，或按照人体 的需要释放精确 的胰 岛素，等等。 斯 (Christina Aga— 参赛者没有时间表征这些部件 。 pakis)认为 ．尽管 “存 来 自意大利 帕维亚大学 的一 在很 多 阻碍 工 程 学 个 iGEM参赛 团队．在优化微生物 的生物学 问题 。”但 中的乳糖发酵时 ．通过把启动子 这 还 不 足 以阻止 合 放置在大肠杆菌 (一种标准的实 成 生 物 学领 域 的开 验室细菌)中 ．检测 了取 自 “标准 拓者们 ，他们 已经在 生物部件登记处”的一些启动子 。 着 手 解 决 以下 5个 尽管 该 团队检测 的大部分启动子 对合 成生物学的发展 ，媒体的报道 曾引发人 关键的挑 战。 都能工作 ．但其 中的几个启动子 们对其未来充满了幢憬。现实是．该领域还有许多 挑战 1：很多部 几乎没有文献报道 ，包括一个启 有待攻克的瓶颈 件不明确 动子没有活性 。雷特伯格说 ，大约 由于所有 的生命都建立在大 生物部件可 以是从编码特异 l500个登记处部件 已被其他人 、 致相 同的遗传密码之上 ，而合成 蛋 白质 的DNA序列到启动子 (即 而不 是当时存放它们 的人证实 生物学能够提供可重复使用的遗 促进基 因表达的序列) 的任何东 过 ．其 中 50个部件据报道是不成 传成份 的工具箱——生物学版本 西．问题是很多部件还没有被表 功 的 ，200个部件被报道有 “问 的 “晶体管 ”和 “开关 ”—— 以便任 征清楚 。即使进行过测试 ，它们的 题 ”．剩余部件中究竟有多少 已被 意插入 “电路 ”。受到激励 的生物 性能也会随细胞类型 的不 同或不 检测 ．目前尚不清楚。 学家们似乎认为基 因工程可 以扩 同的实验室条件而改变。 加州大学伯克利分校的合成 展到所有 的领域 ，具体做法是 ：行 例如 ，设在麻省理工学院的 生 物 学 家 亚 当 ·阿 金 (Adam 使所需功能的遗传序列 ，即把某 “标准生物部件登记处 ”已有超过 Arkin)、 杰 伊 ·科 斯 林 (Jay 些 “部件 ”表征 出来 ，形成 “装置 ” 5000个可以订购 的部件 ，但不能 Keasling)和斯坦福大学的德鲁 ·恩 以获得更复杂 的功能，然后把这 保证它们 的质量 ．该登记处主任 迪 (DrewEndy)正在发起一项新的 些 “装置 ”插入细胞中。 兰迪 ·雷特 伯格 (RandvRettberg) 名为 “BIOFAB”的计划 。以便开发 但 随着合成生物学 网络不断 说 。其 中大多数部件是 由参加 国 和表征新的和已存在