中国大豆疫霉菌群体遗传结构RFLP分析.pdfVIP

中国农业科学 2011,44(20)：4190—4198 ScientiaAgriculturaSinica doi：10．3864~．issn．0578—1752．2011．20．007 中国大豆疫霉菌群体遗传结构的RFLP分析 肖江涛，苗 苗，高 坤，向桂林，杨 帅，董莎萌，王源超，王克荣 (南京农业大学农业部病虫监测 与治理重点开放实验室，南京 210095) 摘要：【目的1分析中国大豆疫霉菌的群体遗传结构，探索不同地区大豆疫霉菌群体间的亲缘关系。【方法】 采用 RFLP(restrictionfragmentlengthpolymorphism)技术，对大豆疫霉菌进行群体遗传结构的分析；利用 PopgeneV1．32软件计算大豆疫霉菌群体间的遗传相似度；利用NTSYSpcg2．10软件估算菌株间的遗传距离，并 依据遗传距离构建UPGMA(unweightedpalr—groupmethodwitharithmeticaverages)系统树状图谱。【结果】 采用探针 PS127558对来 自黑龙江、新疆和内蒙古等5个大豆疫霉菌地理群体的133个菌株的遗传多样性进行 了分 析，共得到25条杂交带，其中多态性条带为24个，占96％。黑龙江分别和新疆、内蒙古群体间遗传相似度较高。 相对于黑龙江群体遗传结构的高度复杂性，新疆和内蒙古菌株的群体遗传结构则比较简单，分别有 88．2％和 100％ 的菌株分属于同一聚类组，且均有超过58％的菌株和部分黑龙江菌株指纹图谱完全相同。Shannon’S多样性指数也 表明黑龙江群体的遗传多样性最为丰富。福建和其它群体之间的遗传相似度较低，且分别有 45．5％和54．5％的福建 群体都属于聚类组E和F，遗传背景较为单一。福建群体的Shannon’S多样性指数低于黑龙江和美国。美国和黑龙 江群体之间的遗传相似度较高，且部分美国菌株和黑龙江菌株指纹图谱相同。【结论】新疆、内蒙古的大豆疫霉菌 起源于黑龙江，福建的大豆疫霉菌可能为一个独立的进化分支或起源于其它地区。此外，中国和美国的大豆疫霉 菌群体问存在菌源交流。 关键词：大豆疫霉根腐病；大豆疫霉菌；群体遗传；起源；RFLP GeneticDiversityofPhytophthorasojaeinChinaBasedonRFLP XIAOJiang—tao，M IAOM iao，GAOKun，X!ANGGui—lin，YANG Shuai，DONG Suo—meng， W ANG Yuan—chao．WANG Ke—rong (KeyLaboratoryofMonitoringandManagementofPlantDiseasesandInsects，MinistryofAgriculture,NanjingAgricultural University,Nanjing210095) Abstract： 【Objective] TheobjectiveofthisstudyistoexplorethegeneticdiversityamongPhytophthorasojaestrainsrfom soybean—growingregionsinChinaandAmerica．[Method]Restrictionrfagmentlengthpolymorphism (RFLP)wasusedtoexamine thegeneticrelationshipsamongstrainsofP．sojaecollectedfrom5differentregions．Nei’SgeneticdistancesamongthestrainsofP． sojaewerecalculated，andclusteranalysisusingUFGMAmethodwascarriedoutbyusingthesoftwarepackageNTSYSpcV2．10． ThePopgeneV1．32wasusedforcalculationofgeneticidentity． [ResultI RF