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2017-08-30 发布于河北
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利用缓冲区提高Java应用程序的I／O性能.pdf

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维普资讯 CN43-1258／TP 计算机工程与科学 2007年第 29卷第 12期 ISSN 1007—130X COMPUTERENGINEERINGSCIENCE Vo1．29，No．12，2007 文章编号：1007-130X(2007)12-0151-03 利用缓冲区提高Java应用程序的I／O性能 How toUsetheI／OBuffertoImprovetheI／O PerformanceofJavaApplications 秦振吉，李枝青 QINzlIeI卜ji，LIZhi-qing (山西大学晋中学院计算机系，山西榆次040600) (DepartmentofComputerScience，JinzhongSchool，ShanxiUniversity-Yuci040600，China) 摘要：Java语言的跨平台特性使得其在各个领域得到了广泛应用。与此同时，Java应用程序的性能，特别是 I／O性能，也是人们普遍关注的话题。本文采用一个生物信息学应用程序的实例来探讨如何利用I／O缓冲区提高Java应用程序的I／O性能。我们采用三种不同的I／O缓冲区的实现方式来实现该应用程序，对其进行性能分析比较并将其与相应的C ++应用程序进行比较。大量实验表明，I／O缓冲区对于Java应用程序的I／O性能起着至关重要的作用。恰当地使用I／ O缓冲区，某些场合下能使Java应用程序的I／O性能略高于相应的C++应用程序的I／O性能。 Abstract．Thecross-platfo1TnfeatureoftheJavalanguageenablesJavatobewidelyusedinmanyareas．Menawhile，the performanceofJavaapplications，especiallytheI／Operformance，isalsoahottopic．Inthispaper，abioinformaticsapplica— tionisusedasanexampletOd‘emonstratehowtOusetheI／ObuffertOimprovetheI／OperformanceofJavaapplications． Theauthorsusethreedifferentwaysofusingthe1／ObuffertOmiplme enthtebioinformaticsapplication．Thecomparisona— mong theperformancesofthethreedifferentmi plme entationsisdiscussed．Andtheauthorsalsocomparetheperformances ofthehtreemiplme entationswiththatofhtecorrespondingC++ application．ManyexperimentsshowthathteI／0buffer hasaremarkableeffectonhteI／0performanceofJavaapplications．Byusing I／Obuffersappropriately，hteI／0perform- anteofJavaapplicationsCna behigherthna thatofhteC++ applicationsinsomecases．关键词：缓冲区；输入输出；性能；基因序列搜索 Keywords：buffer；I／O；performance；Motifsearch 中图分类号：TP311 文献标识码：A 一。基因数据库的数据存放方式决定了相应的基因序列