Bcl-2蛋白结合底物时的诱导契合及高效抑制剂的柔性对接研究.pdfVIP

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2017-08-29 发布于江西
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Bcl-2蛋白结合底物时的诱导契合及高效抑制剂的柔性对接研究.pdf

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Bcl-2蛋白结合底物时的诱导契合及高效抑制剂的柔性对接研究.pdf

2006年第“卷化学学报 V01．64，2006 第23期．2327～2332 ACTACHIMICASINICA ·研究论文· Bcl-2蛋白结合底物时的诱导契合及高效抑制剂的柔性对接研究郑灿辉周有骏术朱驹陈军李耀武盛春泉宋云龙蒋庆锋吕加国 (第二军医大学药学院药物化学教研室上海200433) 摘要Bcl．2蛋白是目前抗肿瘤药物研究很具前景的新靶点．Bcl．2蛋白与底物作用的活性腔生理情况下是蛋白与蛋白作用接触面大而平坦，与底物结合时发生明显的诱导契合．通过分析和比较Bcl．2蛋白和其高同源的Bcl．XL蛋白的自由状态及与底物复合时的9个相关三维结构模型，明确了蛋白及活性腔的骨架结构特征，活性腔内的重要位点和关键残基，及它们结合底物时发生的诱导契合．基于以上认识，采用柔性对接的方法得到了高亲和力的小分子抑制剂与Bcl．2 蛋白的合理结合模式，为以后设计合成新型高效Bcl．2蛋白抑制剂打下了坚实基础．关键词Bcl．2蛋白；结构比较；诱导契合；分子对接；抗肿瘤药物 InducedFitWhen SubstratesofBcl-2ProteinandFlexible Binding Inhibitor ofa Potent DockingStudyHigh ZHENG，Can-HuiZHOU，You—Jun水ZHU，JtiCHEN，JunLI，Yao—Wu SHENG，Chun—Quan LO，Jia—Guo SONG，Yun-LongJIANG，Qing-Feng Medical 200433) (DepartmentofMedicinalChemistry，SchoolofPharmacy，SecondMilitary University，Shanghai AbstractBcl一2 isanew ofanticancerwith now．Theactivesiteof protein target drugs brightprospect Bcl一2 isa interfaceunder involvesand condition，and proteinprotein-protein physiological largerelatively fiatsurfaceareasandobviousinducedfitwhen and ninecor- bindingsubstrates．Byanalyzingcomparing relative3DstructuremodelsofBcl一2and infreeor backbone homologicalBcl—XLprotein complexstate，the structure sitesandinducedfitof andtheiractivesiteswereidentified．Basedonabove features，key