T_RFLP技术在人肠道柔嫩梭菌类群的组成分析中的应用.pdfVIP

696 Ch ine se Jou rnal of M icroeco logy, A ug2009 , Vo l2 1 No8 文章编号 : 1005376X (2009) 【论 　　著 】 TRFLP技术在人肠道柔嫩梭菌类群的组成分析中的应用 柳欣源 , 申剑 ,王婷婷 ,李旻 ,赵立平 ,庞小燕 (上海交通大学生命科学技术学院 微生物分子生态与生态基因组学实验室 ,上海 　200240) ( 　　【摘要 】　目的　建立能快速筛查和比较大规模人群肠道中柔嫩梭菌类群组成结构的 TRFL P 末端限制性片 ) 段长度多态性 。方法 　采用 TRFL P技术特异性地分析柔嫩梭菌类群的组成 ,考察该方法的重复性和灵敏度 。用 该方法对 15个志愿者肠道中的柔嫩梭菌类群进行分析 ,并与 D GGE方法分析的结果进行对比。结果 　TRFL P方 法重复性高 ,最低能检测到群落中 1%的细菌 ,其结果与 D GGE 的分析结果具有较好的一致性 。结论 　本研究建立 的柔嫩梭菌类群特异性的 TRFL P方法能够对大量肠道样品中柔嫩梭菌类群的结构进行快速 、有效的筛查和比较 。 【关键词 】　TRFL P;柔嫩梭菌类群 ;多样性 【中图分类号 】Q785 　　　　【文献标识码 】A The app lica tion of TRFL P in ana lyz ing C lostr id ium lep tum group in hum an gut m i crob iota L IU X inyuan , SH EN J ian ,WAN G Tingting, L IM in , ZHAO L ip ing, PAN G X iaoyan (L ab of M olecu la rM icrobia l E cology and E cog enom ics, S chool of L if e S cience and Technology, S hang ha i J iaotong Un ivers i ty, S hangha i 200240, Ch ina) 【A b stract】　O bjective 　To e stab lish a group sp ecific Term inal R e striction Fragm en t L ength Polymorph ism s ( T R FL P) m ethod to analyze the structu re of C los trid ium lep tum group in hum an gut samp le s co llected from largescale popu la tion s. M ethod　 The rep roducib ility and sen sitivity of C los trid ium lep tum group sp ecific TRFL P was determ ined. TRFL P and D GGE were u sed to analyze the fecal C los trid ium lep tum subgroup of 15 hum an subjects and the re su lts were comp ared to evaluate the con sistency of the two techn ique s. Result　The C los trid ium lep tum group sp ecific TRFL