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南京农业大学学报 2006,29 (3):33 38
JournalofNa ngAgriculturalUniversity
水稻 白叶枯病菌 基因的克隆、测序及敲除研究
杨万风,刘红霞,娄吻,胡 白石,许志刚,刘凤权
(南京农业大学农业部病虫监测与治理重点开放实验室,江苏 南京 210095)
摘要:根据黄单胞菌gaeA基因的同源性设计简并引物,采用 PCR方法从水稻白叶枯病菌 (Xanthomonasoryzaepv.
oryzae,Xoo)中克隆了gacA同源基因,命名为gacAx~。序列比较显示 ,该基因在黄单胞菌中是相对保守的。蛋白质保
守结构域搜索表明,GacA 属于LuxR家庭的一员 ,具有与其他 GacA蛋白相似的结构。通过同源重组的方法 ,构建了
gacAx 的插入突变体,为下一步研究gacAxoo的功能奠定了良好的基础。
~
关键词:水稻白叶枯病菌; 基因;基因敲除
中图分类号:Q78 文献标识码:A 文章编号:1000—2030 (2006)03—0033—06
uClioomninngg,●sseeqqulencintggaanndkl~nnoocck-oouuttoofigacA genneeflrroqm
Xanthomonasoryzaepv. oryzae
YANG Wan-feng,LIU Hong-xia,LOU Yang,HU Bai—shi,XU Zhi—gang,LIU Feng—quan
(KeyLaboratoryofMonitoringandManagementofPlantDiseasesandInsects,MinistryofA culture,
NanjingA culturalUniversity,Nanjing210095,China)
Abstract:AgacA homologue,designatedgacAx~ , wasclonedfromthegenomicDNAofXanthomonasoryzaepv.oryzae (Xoo),
abacteriumthatcausesbacterialblightofrice,withdegeneratedprimersbypolymeraseamplificationreaction (PCR).NCBIblast
searchindicatedthatGacAx hadasimilarstructuretothatofotherGacA proteins,andhadconserveddomainofLuxR—likepro—
。 。
teins.SequencecomparisonshowedthatgacAX wasconservedintheXanthomonasgenus.A gacAx~disruptionmutantWas SUC—
oo
cessfuHygeneratedbyasinglecross—overevent,selectedbyAmpresistanceonNA medium andconfirmedbyPCR andSouthern
,
blot.ThismutantisausefultoolforfurtherstudyonthefunctionofgacAx inX.oryzaepv.oryzae.
~
Keywords:Xanthomonasoryzae
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