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sgf73+在裂殖酵母中的大规模遗传筛选.pdf

遵 Hereditas(Beijing)2014年7月,36(7):723--731 WWW.chinagene.CR 研究报告 s~j73+在裂殖酵母中的大规模遗传筛选 郭雨辰,雷秉坤,邓小龙,余矗,吕红 复旦大学生命科学学院,遗传工程国家重点实验室,上海 200433 摘要:遗传相互作用(Geneticinteraction,GI)直接提示了生物体内各个基因在功能上的关联性,为研究一个基 因的潜在功能提供了线索。遗传筛选是研究基因遗传相互作用的重要方法。文章以 SAGA(Spt.Ada.Gcn5ace. tyltransferase)复合物去泛素化模块亚基基因sg/73为查询基因,在裂殖酵母(Schizosaccharomycespombe)~进行 了大规模遗传筛选。结果显示,164个基因与 sg/73具有负遗传相互作用,42个基因具有正遗传相互作用。 GO(Geneontology)分析结果表明,这些基因富集于染色质修饰、DNA损伤修复 压力应答、RNA转录等生物 过程。通过组蛋 白修饰检测实验首次发现,sgt73的缺失导致组蛋 白H3K9、H4K16位点乙酰化水平下降,H3K4 位点甲基化修饰水平上升。此外,系列稀释实验显示sg/73A菌株对DNA损伤试剂HU和CPT的敏感性提高,并 且Sgf73参与高氧胁迫应答。这些结果显示sgt73参与了染色质修饰、DNA损伤修复和高氧压力应答过程。 关键词:遗传相互作用;裂殖酵母;seg73;组蛋白修饰;DNA损伤修复;压力应答 LLargescalescreenin‘gofggeenneettiicciinntteerraacctmo‘nnwithsgf77J3 infission yeast YuchenGuo,BingkunLei,XiaolongDeng,YaoYu,HongLV StateKeyLaboratoryofGeneticEngineering,SchoolofZifeSciences,FudanUniversity,Shanghai200433,China Abstra~:Geneticinteraction(GDnotonlysuggestsfunctionalcorrelationsbetweendifferentgenesinvivo,butalsopro- videscluesforunderstandingthepotentialbiologicalfunctionofaspecificgene.ScreeningofGIisanimportantmethod forunderstandingGIbewteendifferentgenes.Inhtisstudy,weselectedseg73 asaquery,whichencodesasubun itof SAGA(Spt-Ada-Gcn5acetyltrnasferase)complexdeubiquitinationmodule,toperform alargescalescreeningofGIinfis— sionyeast.Ourdatashowedthat164geneshadnegativeGIswhereas42geneshadpositiveGIswimsgF3.GOfGene ontology)analysisindicatedhtathtesegeneswereenrichedinseveralimportantbiologicalprocesses,includingchromatin modification,DNA damagerepair,cellularresponsetostress,RNA rtnascriptionnadSOon.Byusinghistonemodification detection,weshowedofrhtefirsttimehtatlossofsgf73ledtoadecreasedlevelofhistoneacetylationatH3K9andH4K16 nadna nicreasedlevelofhistoneH3K4methylation.Furthermore,htespotassayresultsshowedhtathtesgf73Acellsexhi— bitedincreasedsensitivitytoDNA dma ageagents,HU nadCPT,nadsgt73 wasinvolvedin

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