鸡肉质性状候选基因挖掘及全基因组选择技术研究.pdfVIP

第十一届优质鸡的改良生产暨发展研讨会  海口  鸡肉质性状候选基因挖掘及全基因组选择技术研究  文杰 （中国农业科学院北京畜牧兽医所，北京 100193 ） 肉品质是肉鸡生产最重要的经济性状之一，针对其遗传机理的解析一直是本领域研究的热点和难点。 本研究以北京油鸡保种群及北京油鸡和科宝肉鸡杂交构建的 F2 资源群体为素材，基于高通量单核苷酸 （SNP）芯片测定，开展肉质性状全基因关联分析（GWAS）研究，并对发现的部分新基因进行功能鉴 定。同时开展全基因组选择技术（Genomic Selection，GS）及应用效果研究。 利用 F2 资源群体中 367 个样本的表型记录和 SNP 芯片测定结果，筛选获得了影响肌内脂肪含量、 肌肉干物质含量及肉色等性状相关的候选基因 14 个，包括微粒体谷胱甘肽 S 转移酶 1 （MGST1 ）、原 癌基因（RET ）、胆固醇元件结合转录因子 1（SREBF1）等。针对腹脂沉积相关新基因利钠肽前体 B/NPPB ， 构建了过表达载体和干扰载体，在鸡前脂肪细胞水平对其进行过表达/ 消减实验，证明NPPB 基因具有 促进鸡前脂肪细胞的增殖，抑制分化的作用；利用 728 只北京油鸡保种群的表型记录，发现 3 号染色体 一个 5 Mb 左右区间内大部分 SNP 均与胸肌重（率）显著关联。进一步对不同发育阶段胸肌组织 mRNA 表达丰度进行分析，鉴定出区域内的一个主效基因，GJA1 基因，该基因编码一种缝隙连接蛋白，在细 胞连接相关通路中起作用。 全基因组选择群体包括 GS 参考群、待测群、同胞选择群和随机交配的对照群。分别用 GS 选择法、 同胞选择法和随机留种法对三个群体进行选种。其中 GS 选择群体综合参考群基因型和表型、GS 待测 群的基因型，利用 GBLUP 方法计算获得待测群全基因组估计育种值（GEBV），进行选种。选择两个世 代后，利用全基因选择和同胞选择方法选择的群体平均肌内脂肪含量达 2.93% ，均比随机留种鸡群进展 提高 10%，遗传进展显著。证明全基因组选择方法在对肉质性状等活体不易测量的复杂性状的选择中 具有应用前景。                                                               作者简介：文杰，中国农业科学院北京畜牧兽医研究所副所长、研究员、博士生导师，国家肉鸡产业技术体系首席 科学家，主要研究方向优质鸡育种。Email: wenjie@caas.cn  1