基于分子指纹相似性的药物-药物网络.pdfVIP

Vol_38NO．3 华 东 理 工 大 学 学 报 (自然 科 学 版) andTechnology (NaturalScienceEdition) 301 201206 JournalofEastChinaUniversityofScience 文章编号 ：1006—3080(2012)03—0301—06 基于分子指纹相似性的药物一药物网络 叶 浩 。， 唐凯临 ， 李亦学 。 (1．华东理工大学生物反应器工程 国家重点实验室，上海 200237； 2．上海生物信息技术研究中心，上海 200235) 摘要 ：根据分子指纹相似性构建 了FDA批 准的小分子 药物 的药物一药物 网络 ，结合 药物 ATC 分类系统 中定义 的药物治疗功能信息，提 出了一种基 于 网络 的药物功能预测方法 。预测 了 1277 个药物一治疗功能关系对，其 中有 59．44 得到 了文献 的证 实；337个 已知 ATC分类的药物 (占 ATC药物的55．89 )的预测功能与已知功能相符 ；那些尚未有文献支持的药物一治疗功能关系对， 很可能暗示了药物潜在的新功能。 关键词 ：分子指纹 ；药物一药物 网络 ；药物新功能预测 中图分类号 ：Q811．4 文献标志码 ：A Drug-DrugNetworkBased on Sim ilarityofM olecularFingerprint yF H ∞ -一。 TANG Kai—lin 。 LJYi．2cue (1．StateKeyLaboratoryofBioreactorEngineering。EastChinaUniversityofScienceand Technology，Shanghai200237，China； 2．ShanghaiCenterforBioinformationTechnology，Shanghai200235，China) Abstract：W ebuiltanetworkofFDA—approved smalldrugs，according to thesimilarityofmolecular fingerprint．W ith the therapeuticfunction indicated in drug ATC classification system ，we propose a methodtopredictthenew function ofdrugsbasedon the drug—drugnetwork． 1277Drug—therapeutic functionpairswerepredicted，about59．44 ofthem weresupportedbyscientificliteratures ． Predicted functionsof55．89 drugswith knownATC codewerewell—matchedwith their approved therapeutic function．W hile，theunmatheddrug—therapeuticpairsmayindicatenew functionsofdrugs 。 Keywords：molecularfingerprint；drug—drugnetwork；drugnew indicationprediction 新药