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DDGrid-一种大规模药物虚拟筛选网格.pdf

CN43—1258/TP 计算机工程与科学 2009年第3l卷第Al期 ISSN1007—130X v01.3l。No.A1,2009 COMPUTERENGINEERINGSCIENCE 文章编号:1007—130X 2009 Al一0312—03 DDGrid:一种大规模药物虚拟筛选网格 withMassive Grid DDGrid:A Drug Support Virtual——Screening 李祖华1,张军1。王永剑2。于坤千3 LI Zu-hnal,ZtlANGJmll。WANG Y佃譬iia舻.YUKma-qijms 1.江南计算技术研究所。江苏无锡214083; 2.北京航空航天大学计算机学院中德软件技术联合研究所,北京100083;3.中科院上海药物研究所,上海201203 I Instituteof 214083; 1.JiangNan ComputingTechnology,Wuxi 2.Sino-GemmnJointSoftware Institute,ueihaIlgUniversity。BeBing100083; InstituteofMateria of 3.Shanghai Medica,ChineseSciences。Shanghai201203。China Academy 摘要:化合物活性筛选是创新药物研究的起点和具有决定意义的步骤,利用网格计算技术进行药物虚拟筛选能够极 重要支持项目,通过实施主从模式架构并在网格资源监控中使用适配器模式,DDGrid可以对超过10万规模的化合物分子 数据库进行虚拟筛选。 isthe of is effectivein virtual— Abstract:Compoundsactivityscreeningkeydrugdiscovery.GridComputingvery drug canreducecostandtime Grid isall screening,which greatly.DDGrid DrugDiscovery importantsupported project by CNGrid ChinaNational the frameworkandthe modelin can Grid .Withmaster/worker monitor,DDGrid adapter grid a taskwithmorethan 10,000 supportvirtual—screening compounds. 关键词:药物发现;虚拟筛选;网格监控

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