不同倍性鱼线粒体全基因组及肝脏转录组中线粒体相关基因研究.pdfVIP

分类号 密级 学校代码 !Q5丝 学号2Q!QQ!!垒Q!垒鱼 不同倍性鱼线粒体全基因组及肝脏转录组 中线粒体相关基因分析 onthe mitochondrial Studies complete in andmitochondra—-related genomes genes 0IofOllIeren reviltlivenet reffid ptc transcriptome fish polyploid 研 究 生 姓名 尤翠平 指导教师姓名、职称 刘少军教授 学 科 专 业 发育生物学 研 究 方 向 生殖细胞发生与性别分化机制 湖南师范大学学位评定委员会办公室 二零一二年六月 摘 要 杂交和多倍化是基因组进化的重要驱动力，是物种多样化和产生 新物种的重要途径。人工多倍体鱼的研究不仅在水产育种上具有重要 的研究价值，在生物学基础理论研究方面也具有重要的意义，对不同 倍性鱼的分子生物学研究可以帮助理解进化中物种发生多倍化或基因 组复制的遗传机理以及物种在多倍化发生早期的分子遗传状况，同时 由于杂交多倍体鱼含有不同的基因组，使其成为很好的研究线粒体母 性遗传和核质互作的模型。线粒体是真核生物的能量工厂，具有自己 DNA，mtDNA)，其正常功 的遗传系统一线粒体基因组(mitochondrial 能的运行需要线粒体基因组和核基因组的协同作用。线粒体DNA具有 小型性、自主性和多态性等特点。对线粒体DNA的研究除了能揭示线 粒体DNA的结构、基因表达及其功能外，还在核质互作、分子进化规 律、物种起源与分化等方面具有重要的意义。本文应用多种分子生物 学技术，结合相关的生物信息学知识对不同倍性鲫鲂的线粒体基因组 和四倍体鲫鲤及其亲本肝脏转录组中的线粒体相关核基因进行了较系 统的探讨和研究，并对两种鲤科鱼类翘嘴鱼自和黄尾鲴的线粒体DNA全 序列进行了系统分析。本论文的主要研究内容如下： 1．对天然雌核发育红鲫、三倍体鲫鲂和四倍体鲫鲂的线粒体基因 组全序列进行了测序，研究充分利用各种生物信息学软件，系统详细 的阐明了这些不同倍性杂交鱼线粒体DNA的分子结构、碱基组成、基 因组成和排列等特点。天然雌核发育红鲫、三倍体鲫鲂和四倍体鲫鲂 线粒体基因组序列全长均为16580bp，与母本红鲫的线粒体基因组序列 长度一致。通过与亲本红鲫和团头鲂线粒体基因组全序列的比较，我 们发现无论是在线粒体基因组的结构还是全序列的同源性比较上，三 种鲫鲂不同倍性杂交鱼的线粒体全基因组均与母本红鲫更相似，研究 表明尽管经历了杂交和多倍化，不同倍性鱼的线粒体DNA仍然遵循母 性遗传规律。同时结果也说明在线粒体基因组水平不能体现出不同倍 性杂交鱼与父本团头鲂具有亲缘关系，这一点提示我们在利用线粒体 基因组对鱼类特别是杂交鱼类进行系统关系研究时应该注意其有效 性。 2．以四倍体鲫鲂为母本以团头鲂为父本进行了四倍体鲫鲂的回交 实验，在检测的三尾回交子