LabVIEW和NICompactDAQ开发更智能化的便携式流感诊断系统.docVIP

LabVIEW 和NI CompactDAQ 开发更智能化的便携 式流感诊断系统  图1(A). 我们 的小型PCR设备可 以与电脑USB接口 交互，该PCR设备 由LabVIEW应 用程序来驱动，通过 该应用程序，可以显 示实时温度值和实时 PCR结果和分析。  利用NI公司的 Compact DAQ硬件系统，以 及用于控制和数据分 析的LabVIEW 图形化系统设计软 件，我们创建了一个 小型且便携式的系 统。 - Hsieh Tseng Ming James, Institute of Bioengineering and Nanotechnology, A-Star The Challenge: 开发一个比传统系统 更加易于使用的，易 于携带的，并且成本 更低廉的小型热循环 仪。 The Solution: 使用NI公司的 CompactDAQ 硬件系统和 LabVIEW软件 来创建小型热循环 仪，并且凭借USB 接口的即插即用功 能，以执行实时的聚 合酶链反应。  Author (s): Hsieh Tseng Ming James - Institute of Bioengineering and Nanotechnology, A-Star 聚合酶链反应 （PCR）热循环是 进行分子诊断的黄金 准则。然而，在应对 流感大流行方面，全 球所面临的主要挑战 是只有专业人员才能 进行有效的诊断测 试。此外，商业上可 用的热循环仪也只能 用于实验室环境使 用，因此，我们很难 对其进行操作，要将 商用热循环仪的应用 领域扩大到紧急情况 下，以及公共检测 站，例如机场，其笨 重且昂贵的特性无疑 是一个障碍。因此， 迫切需要我们开发一 种便宜的，可携带 的，且可任意使用的 分子诊断工具。 为了提供灵活的，成 本低廉的诊断系统， 我们在新加坡生物工 程和纳米技术研究所 的研究小组开发了一 个小型诊断系统，该 诊断系统采用美国疾 病控制和预防中心 （CDC）所推荐的 PCR技术来检测传 染性急病。我们的系 统从实时PCR到病 毒基因目标链的检测 对整个诊断过程进行 整合与自动化，以执 行数据的分析。 通过使用NI 公司的 CompactDAQ硬件系统，以及用于 控制和数据分析的LabVIEW图形化系统设计软件 作为我们的解决方 案，我们创建了一个 小型且便携式的系 统。该系统由一个较 小的珀尔帖器（温度 装置），电源供应器 （能量装置），和具 有USB接口即插即 用功能的光检测器 （光学装置）构成。 我们的热循环仪是便 携式的，完全自动化 的，且可用于在重要 场合中大规模健康检 查的情况下使用，例 如在机场检查站控制 传染性疾病的传播。 系统自动化是可靠诊 断的一个关键优势， 因为流感大流行可能 会在偏远地区发生， 那里可能没有受过专 业训练的人员处理试 验样品。此外，系统 自动化的实现大大降 低了人力和培训费 用。 利用该系统同时运行 包含预加载PCR反 应物的三个聚合物， 从抽样到结果所花费 时间不到一小时，并 且允许采用大量生物 的多样性。利用热敏 电阻的实时温度反 馈，一个内部比例积 分微分(PID)芯 片来处理温度控制。 该控制器由一个补偿 器，输出装置和传感 器反馈信号组成，反 馈信号对于控制加热 器输出功率，以及保 持温度是很必要的。 使用LabVIEW 软件，我们对图形用 户接口进行编程，以 显示实时温度，设置 温度，并且显示来自 三个通道的实时 PCR结果 (如图 1A所示)。 系统配置 整个集成系统的配置 包括执行PCR系统 运行和反应的循环温 控系统、固定安装的 三个蓝色LED光 源、排布于LED至 光电倍增管 (PMT)光路之间 用于实时光学探测的 相关透镜和滤波器。 系统中包括一组铜制 或黄铜制的加热室， 与放置样本的聚合体 反应室集成在一起。 LabVIEW是系 统构架的核心，中心 处理器单元的设计专 门针对执行由 LabVIEW预编 写的指令，可用于控 制系统启动和健康检 查、PCR运行的热 量循环控制、和多路 复用荧光信号的光学 检测。 在PCR处理的循环 温控过程中，系统于 退火循环的最后一秒 进行光学检测。三个 LED同时由来自 NI 9265模拟 输出模块的电流驱动 依次点亮，每个 LED持续发光 200 ms，在下 一个LED灯点亮前 熄灭当前LED灯。 特殊设计的装置用于 聚焦和引导LED光 路传输。光在照射到 放置DNA样本的反 应室之前要先通过一 个滤波器。光线在到 达PMT之前还需通 过一系列透镜和滤波 器，最后由NI 9206模拟输入模 块读出该信号。 我们使用 LabVIEW来进 行信号处理以获取数 据集的均值，来自 PMT的信号被放大 并处理。之后将向用 户显示数据，并通