虚拟活性化合物的自动生成.pdfVIP

2000年第58卷 化学学报 V01．58，2000 第5期，529～532 ACrACⅢMICAsINICA No．5，529～532 虚拟活性化合物的自动生成 陈海峰 荔建锋 姚建华 袁身刚。 郑崇直 (中国科学院上海有机化学研究所计算机化学开放实验室上海200032) 摘要虚拟活性化合物的自动生成是从药效团和预先设定的结构碎片出发，通过碎片选择、碎片组装和柔性构象搜 索来获得虚拟活性结构．经过对HIV一1蛋白酶抑制剂药效团进行虚拟活性化合物生成，得到了16个虚拟活性化合 物，通过构象分析发现生成的化合物满足药效团的限制条件．说明这一方法能够有效的生成虚拟活性结构，与药效 团检索结果对比发现生成的虚拟活性结构新颖易于合成． 关键词 虚拟活性化合物，自动生成，药效团，HIV一1蛋白酶抑制剂 VirtualBio—-Active