第八章 真核生基因表达调控.docVIP

第八章 真核生物基因表达调控 概述 真核生物和原核生物在基因表达调控上有以下三点不同：1. 转录的激活总是伴随着转录区染色质结构的变化。2. 基因表达调控以正调控为主。3. 转录和翻译在时空上是分离的。真核生物转录的起始是基因表达调控最主要的步骤。真核生物基因的表达能在几个连续步骤中的任一步中以基因特有的方式受到调控。真核生物体内各种细胞表型的差异主要是编码蛋白质的基因的表达不同引起的。这些编码蛋白质的基因都经过RNA聚合酶Ⅱ转录。真核生物基因表达调控的控制点包括：1. 基因结构的激活（活化）。细胞中处于“活化”状态的基因才得到表达，变成“活化”结构是基因表达的第一步。2. 处于活化状态基因的转录由转录起始阶段控制。3. 转录过程中的调控。4. 转录产物的后加工。除了加帽、加尾、去除内含子和连接外显子以外，在核RNA水平上，真核生物还可以通过改变剪接类型实现调控蛋白质产物的类型。5. 胞浆中一个特定的mRNA 是否被翻译仍被调控。 第二节 真核生物基因转录调控 真核生物绝大多数基因调控发生在转录起始阶段，但由于基因表达的控制可发生在多个阶段，因此RNA产物的产生并不一定会形成蛋白质产物。组织特异性基因表达调控是真核细胞分化的核心。控制胚胎发育的转录因子大多具有这方面的特点。 一、基因转录的顺式调控元件。真核基因的顺式作用元件按照功能可以分为启动子、增强子以及沉默基因。（一） 启动子的选择。RNA聚合酶Ⅱ的启动子有含有TATA框的典型启动子和不含TATA框的非典型启动子两种。1．含有TATA框的启动子。TATA框是核心启动子中有效的定位成分，也是上游启动子和增强子产生诱导效应所必需的。有时一个基因上有串联着的两个TATA框，它们可分别地或有侧重地对不同的诱导物作出应答。(淀粉酶基因在唾液腺和肝脏中分别选择了转录效率不同的两个转录起始点。2．非典型的启动子。少数基因没有典型的TATA框启动子序列。非典型启动子有的富含GC框，有的则没有GC框。 富含GC 的非典型启动子的转录：含有这类启动子结构的基因的转录起始是不规则的，并且只有基础水平表达。持家基因（housekeeping gene）多以这种转录方式。无TATA框、GC框的基因转录：这类基因启动子上没有TATA框，却在转录起始点附近处形成起始子（initiator，Inr） 。这种元件的保守序列为PyPyANT/APyPy。RNA聚合酶Ⅱ在这些基因上的转录起始于一个或数个紧密成簇的起始元件－转录起始子的A位上。（二）、增强子。增强子（enhancer）最早是在SV40病毒中发现的一段长约200bp的DNA片段，可使旁侧基因的转录效率提高100倍。以后在多种真核生物甚至是原核生物都发现了增强子。增强子是真核细胞中通过启动子来提高转录效率的一种远端的顺式调控元件。增强子相对于启动子的位置不固定。有效的增强子可以位于基因的5’端，也可位于3’端，还可 位于内含子区，一般跨度为100～200 bp。增强子和启动子一样由多种组件构成，其基本的核心元件常由8～12bp组成，可以有完整的或部分的回文结构，以单拷贝或多拷贝串联的形式存在。1. 增强子的特性：增强子能提高同一条DNA链上相邻启动子转录的效率和速率。增强子对同源或异源基因同样有效。增强子的位置可在基因5’上游、基因内或基因的3’下游序列中。增强子在DNA双链中没有5’与3’固定的方向性，将增强子倒置依然有效。增强子可以远离转录起始点，通常在1～4 kb。增强子一般有组织或细胞特异性。增强子的活性与其在DNA双螺旋结构中的空间方向性有关。增强子必需有启动子才可以发挥作用。2．增强子在转录起始点远端起作用的方式：改变DNA序列的整体结构，如影响超螺旋密度等。将DNA双螺旋固定在细胞核内的特定位置，如和核基质相连。有利于DNA拓扑异构酶改变DNA双螺旋结构的张力，促进RNA聚合酶Ⅱ在DNA链上的结合和滑动。作为反式作用因子或RNA聚合酶Ⅱ进入染色质结构的入口。（三）、沉默基因。沉默基因是一种负调控元件，参与基因表达的负调控。沉默基因不受距离和方向的限制，并可对异源基因的表达起促进作用。（四）、转座元件。转座元件（transposable element）的基因调控可能是由于转座元件的插入，带来新的DNA结合蛋白的结合位点，这些可能以增强子的方式远距离地调控基因转录。当这些调控序列转座到原癌基因附近就可使之转变为癌基因，进而产生出肿瘤细胞。 二、通用调控中的调控效应元件。受共同控制的一组基因共用一个被转录调控因子识别的启动子元件。使基因应答此类因子的元件被称为效应元件（response element）。如热激效应元件和糖皮质激素效应元件等。效应元件具有与启动子上游元件或增强子相同的特点。它们含有短的保守序列，调控因子的结合区在保守