RNA的转录合成.pptVIP

原核生物RNA的转录 RNA Transcription in Prokaryotes 大肠杆菌RNA聚合酶 E.coli RNA Polymerase 大肠杆菌σ70 启动子 The E.coli σ70 promoter (2) II型启动子：RNA聚合酶II识别 II型启动子 Promoter Gfp基因在灰盖鬼伞菌丝中的表达 Promoters for RNA polymerase III rRNA 基因(rDNA) 人类rDNA编码产生一个45S的rRNA转录物 (13000nt)，这一转录物随后被切成18S (2000nt), 5.8S (160nt) 和 28S (5000 nt)各1个的 rRNA. 人类细胞在不同的染色体上分布有5簇rDNA重复基因（串联基因簇），每簇有40个拷贝，拷贝之间被非转录的间隔序列分开（图） 这种RNA多基因拷贝的连续转录是产生足够且加工的rRNA。rRNA和蛋白质结合形成了核糖体 (1) I型启动子（ RNA聚合酶I启动子） 45S rRNA processed into rDNA 每一个rRNA簇被称为一个核组织区域（nucleolar organizer regions）. 在rRNA合成活跃阶段，前rRNA转录物与rDNA捆扎在一起可在显微镜下看到“圣诞树” （Christmas tree structures）样的结构.（图） 2. I 型启动子的特征 I型启动子由两部分的转录控制区域构成:核心元件(Core element，CE) 和上游控制元件(Upstream control element, UCE) 前 rDNA RNA Pol I promoters in human cells 上游结合因子(Upstream binding factor1, UBF1)：一种特异DNA结合蛋白, 与UCE和核心元件上游的一段序列结合,UBF1可使转录速率大大增强. UBF1的两个结合位点序列之间没有明显的相似性, UBF1的分子先结合一个序列元件,随后通过蛋白-蛋白之间的互作结合,导致在两个位点间的DNA形成一个环状结构. 3. RNA聚合酶与转录因子 选择因子1(Selectivity factor1, SL1)：聚合酶I 转录所必需. SL1结合并稳定UBF-DNA复合物,且与核心元件游离的下游部分相互作用. SL1本身没有与启动子特异结合的特性,它促使Pol I与UBF-DNA复合物的结合并起始转录. UBF1 UBF1 RNA Pol II (RNA聚合酶II) 1）RNA Pol II 存在于核质中 2）负责所有编码基因和一些snRNA基因的转录 3）合成的前mRNA需经过一系列的加工,如RNA 5’端生成帽子结构、RNA 3‘端加上poly A 尾巴以及内含子剪接 Typical RNA Pol II genes 特征： （1）TATA box：在上游约-25-35bp位置，有7对共有碱基序列5’-TATA（A/T）A（A/T）-3‘。决定RNA Pol II 的位置或正确的起始转录。 （2）帽子位点（Cap site):即转录的起始位点，大都为A碱基。 （3）CAAT box：即上游调控元件（UREs）。保守序列为GG（C/T）CAATCT，一般位 于-75bp附近。该序列确保启动子的有效转录。 A 其他真核生物的启动子： （ 1）缺乏TATA框，只含起始元件，如老鼠的末端脱氧核苷酸转移酶基因，其起始元件位于转录起始点附近，从-6至+11，序列为GCCCTCATTCTGGAGAC。 （2）没有TATA框，也不含起始元件，只有20-50bp的GC区。 这些启动子的转录效率很低。 食用菌gpd启动子： 1 ATTCAAGCAGTCAATGGATTGGAGTGTATTTAGAATCGAAGGTTGTGGAA51 CAAGGAAAAGATGCGGACGAAAAACACAACTGATCCTTTTATAGATAATC101 GCGCTTCAGTCAAATCTTGATTGCGTGATGTTGTGACTTCGACAATAGCC151 CTAAAGTCTAGACCTTAGAACACTTTAGTACCTCGGACCTGCGATTGGGT201 AGGATTTACTGGCCGAGTCCTTTGGGATGGACTGCCAATCAGCAAACGTT251 CTTCAGTTCTATCG