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应用SELDI-TOF-MS技术建立肝细胞癌病人血清蛋白质指纹图谱筛选模型_医学论文
应用SELDI-TOF-MS技术建立肝细胞癌病人血清蛋白质指纹图谱筛选模型_医学论文
作者:闫志勇 刘华 丁守怡 宋旭霞 钱冬萌 田字彬 王斌
【关键词】 肝肿瘤肽谱蛋白质工程
[摘要]目的 研究肝细胞癌(HCC)病人、乙型肝炎病毒(HBV)携带者、健康人血清蛋白质表达的差异,以建立HCC血清蛋白质指纹图谱筛选模型。方法 用表面加强激光解析电离飞行时间质谱技术(SELDI-TOF-MS)获得HCC病人、HBV携带者及健康人血清中的蛋白质指纹图谱,用计算机软件比较分析,并建立HCC的血清蛋白质指纹图谱模型筛选模型。结果 HCC组与非肿瘤组共有11种蛋白质有显著性差异以其中4种蛋白质生物标志物(相对分子质量3 448、6 883、4 467和3 134)组建的筛选模型检测灵敏度为94.6%,特异度为92.3%。结论建立的血清 蛋白质指纹图谱模型能够区分HBV携带者与HCC病人,SELDI-TOF-MS在HCC的诊断及肿瘤特异性蛋白质生物标志分子的筛选等方面具有一定价值。
[关键词] 肝肿瘤肽谱蛋白质工程
[ABSTRACT]ObjectiveTo establish a serum proteomic pattern and study the differences of serum protein spectra of pa-tients with hepatocellular carcinoma (HCC), of HBV carriers and of healthy controls. MethodsProteomic spectra of HCC and age and sex-matched non-HCC controls, including HBsAg carriers and healthy peoples, were generated by surface-enhanced laser desorption/ionization time-of-flight mass spectrometry (SELDI-TOF-MS) on WCX-2 chips. Ciphergen software was used to identi-fy proteomic features, and Biomaker Wizard software to detect the differences in protein peaks between HCC and non-HCC con-trols, and then to set up a serum biomarker pattern to screen the HCC. ResultsEleven proteins were significantly different be-tween HCC and non-HCC controls, among which, four ( m/z 3 448、6 883、4 467 and 3 134) were selected to set up a optimal serum biomarker pattern. This proteomic pattern yielded a high sensitivity (94.6%) and specificity (92.3%). ConclusionThe estab-lished serum proteomic pattern can distinguish the HCC cases from non-HCC ones, and the proteomics approach of SELDI-TOF-MS can greatly facilitate the discovery of new tumor biomarkers.
[KEY WORDS]liver neoplasm peptide mapping protein engineering
原发性肝细胞癌(HCC)是我国常见的恶性肿瘤,居癌症死因第2位,造成其高病死率的主要原因是目前尚缺乏特异性高的早期诊断方法,由于HCC病人早期常无症状,发现时已属中、晚期,丧失了治疗的最佳时机[1]。HCC的发生是一个多因素诱导、多基因突变的漫长的多阶段过程,其中乙型肝炎病毒(HBV)的感染在HCC发生过程中具有重要作用。研究发现,90%的HCC与HBV感染有关[2]。任何疾病在出现病理变化之前,细胞内的蛋白质在成分和数量上都会有相应改变,并通过血清中的蛋 白质模式反映出来。因此,通过比较不同疾病人群血清
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