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第三章 RNA与转录调控 主要内容 真核生物RNA的种类与不同的RNA聚合酶 RNA转录调控 活性染色质结构与转录允许性 转录的起始——不同RNA聚合酶识别不同启动子 转录延伸涉及核小体的解离与重组装 转录的终止——不同RNA聚合酶具有不同的转录终止机制 转录后水平的调控 RNA的剪接与加工 RNA的转运 翻译水平的调控（见下次课） 罕见RNA加工与核酶活性（了解） 教材《医学分子生物学》第六、八章部分内容 参考书《基因Ⅷ》第5、21-25章 真核细胞中RNA的种类 messenger RNA（mRNA ） 遗传信息的传递者（编码蛋白产物） 前体称不均一RNA（heterogeneous RNA，hnRNA） 5’帽子结构 3’ polyA尾巴 成熟mRNA是环状 结构（稳定） PABP——poly A binding protein transfer RNA（tRNA） 大小：70～90nt，存在多种碱基修饰 种类：约80种，占总RNA的约15% 结构 二级结构——三叶草，“三环一臂”（D环、TψC环、反密码子环、（额外环）、氨基酸臂—3‘末端 CCA+Amino acid） 三维结构——“L”型 功能：运载氨基酸至核糖体进行蛋白合成 Ribosomal RNA（rRNA） 核糖体组分 真核生物包括28S、18S、5.8S（以前体形式转录（45S RNA），经加工后产生）和5S rRNA 存在多种碱基修饰 提供核糖体骨架和催化活性位点 核小RNA（small nuclear RNA，snRNA） 长约100～300nt 以核糖核蛋白颗粒（snRNP）形式存在于细胞核内 形成剪接体（spliceosome），包含U1、U2、U4、U5、U6成员，参与mRNA剪接（splicing） 细胞质小RNA（small cytoplasmic RNA，scRNA） 以核糖核蛋白颗粒（snRNP）形式存在于细胞质 7SL RNA组装形成信号识别颗粒（signal recognition particle， SRP），参与蛋白的转运 核仁小RNA（small nucleolar RNA，snoRNA） 独立转录或来源于其他转录基因的内含子 包括H/ACA型和C/D型两种主要类型，共约40种 参与rRNA的剪切、加工（碱基修饰）与核糖体的组装 microRNA 大小：～22nt 细胞定位：主要胞质 前体与加工 primary miRNA：数百或数千nt，包含一个或多个microRNA前体 Drosha酶切割——precursor miRNA（～70nt，茎环结构） 转运出核（Exportin5） Dicer酶切割——成熟miRNA 功能 形成RNA诱导沉默复合物（RNA induced silence complex，RISC） 通过与mRNA3‘UTR碱基互补配对（部分配对），抑制靶基因mRNA翻译 完全配对——靶mRNA降解 长非编码RNA （long non-coding RNA， lncRNA） 长度200bp ，无读码框，不均一RNA 预测占基因组4%～9% 转录形式多样（正向、反向、双向、内含子中、基因间） 功能多样 lncRNA功能的多样性 lncRNA Alzheimer’s Disease 真核生物的RNA聚合酶 RNA是由RNA聚合酶（RNA polymerase）催化合成的。 以DNA为模板合成RNA的过程称为转录（transcription） 真核生物含有三种RNA聚合酶 RNA polymeraseⅠ——转录45S rRNA前体（结构性RNA） RNA polymeraseⅡ——转录mRNA、pri-microRNA、lncRNA（不均一RNA，功能性RNA），snRNA（U1~U5）、snoRNA RNA polymeraseⅢ——转录tRNA、5S rRNA、snRNA（U6）、scRNA、少部分microRNA（小RNA，结构性RNA） 每种RNA聚合酶都包含多个亚基（～12个），聚合体总分子量超过500kDa。 RNA polymeraseⅡ RNA转录过程与调控 转录过程 起始（initiation） 延伸（elongation） 终止（termination） 启动RNA转录的必要条件 活性染色质结构/染色质重构 启动子与增强子 反式作用因子（转录因子、辅激活子） 募集特定RNA聚合酶到转录起始点 转录起始前调控——染色质重构（chromatin remodeling） 染色质结构决定RNA聚合酶的可接近性 高频转录rRNA基因无核小体结构 其他基因——通过染色质重构复合物改变 核小体结构