第六章蛋白质结构和功能关系.pptVIP

第六章 蛋白质结构与功能关系 Knowing the three-dimensional structure of a protein is an important part of understanding how the protein functions. However, the structure shown in two dimensions on a page is deceptively static. Proteins are dynamic molecules whose functions almost invariably depend on interactions with other molecules, and these interactions are affected in physiologically important ways by sometimes subtle, sometimes striking changes in protein conformation. 蛋白质一级结构决定高级结构，决定蛋白质的功能。 The functions of many proteins involve the reversible binding of other molecules. A molecule bound reversibly by a protein is called a ligand.p253 A ligand binds at a site on the protein called the binding site, which is complementary to the ligand in size, shape, charge, and hydrophobic or hydrophilic character. Furthermore, the interaction is specific: the protein can discriminate among the thousands of different molecules in its environment and selectively bind only one or a few. 第一节： 肌红蛋白结构与功能 Myoglobin是重要的氧结合蛋白 一、三级结构 Myoglobin-1peptide plus 1 辅基构成，153AA，MW16,700。脱去血红素谓之珠蛋白。 Kendew等1963年完成鲸肌红蛋白空间结构测定，利用不同分辨率X射线衍射，可以识别出AA残基。 0.6nm，多肽链走向；0.2nm，侧链基团；0.14nm，所有AA残基。 结构：p253由8段a螺旋构成，疏水基团几乎全部位于分子内部。 二、血红素：由原卟啉IX与Fe结合形成血红素，2价，则为亚铁血红素，3+为高铁血红素p254，它以非共价的形式结合于肌红蛋白分子疏水空穴中。 三、O2与肌红蛋白的结合 在氧和肌红蛋白结合时，血红素之Fe在第五配位键与His93 (proximal) 进行结合，而第六配位键与氧结合，另一个氧原子则与His64(distal)作用。p255 五、肌红蛋白氧合曲线 肌红蛋白与氧结合是在组织中，可逆的接受来自Hb的O2，有：MbO2=Mb + O2,该式的解离常数可以描述为： K=[Mb][O2]/[MbO2], (1) 转换后有： [MbO2][Mb]=O2/K (2), 引入Y，定义为给定氧压下肌红蛋白氧饱和度，即MbO2占总Mb的比例Y=[MbO2]/[Mb]+[MbO2]，(3)以（2）式MbO2替换,得：Y=O2/O2+K,按Henry定律，改写为O2分压，则 实践中，Y值可以通过光谱法测量，再以Y对p(O2)作图，得到的曲线为氧合曲线或氧解离曲线。 第二节 Hb 脊椎动物，4个亚基构成，成人主要为HbA，含a2b2。分别为141和146个aa残基。 Hb的近侧F8 His位于a链His87或b链His92，远侧His为E7，分别为His58和His63. 当O2与Hb的一个亚单位之血红素结合时，可导致Fe被拉回血红素平面（只是非常微小的变化），后者又会拖动F8His残基，从而引起Hb构象变化，使Hb的b亚基之间空穴减小，导致BPG被挤出，促使Hb与O2的亲和力增加。 二、Hb氧合曲线 Hb与O2结合的解离常数为： 变形后得： 以n代替4得到一般性方程： 该方程是一个S型曲线，但在n=1 和n=4时，具有显著差别：在n=4时，Hb与 氧的结合显示出高度协同性。P262 把上述方程进行变形，得到： 以 H+，CO