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实时荧光定量PCR (qPCR )
实时荧光定量PCR (qPCR )
提纲
• 实时荧光定量PCR (qPCR )原理
• 实时荧光定量PCR (qPCR )实验设计
PCR反应
荧光物质
Mg2+ Taq DNA多聚酶
或
2+
Mn
模板DNA
dCTP
dGTP
dUTP 引物
dATP
缓冲液
SYBR Green I
SYBR Green I
SYBR Green I
SYBR Green I
荧光曲线
随着PCR反应的进行,扩增产物不断累积,荧光信号强度不
断增加。每经过一个循环,收集一次荧光强度信号,经过一定
的循环后,得到一条荧光扩增曲线图
定量原理
Ct值的概念
Ct值的定义是PCR扩增过程中,扩增产物(荧光
信号)到达阈值时所经过的扩增循环数
C(t) 值 C(t) 值
18.12 +/ - 0.04
阈值线
96孔Ct值的一致性
定量原理
• 理想的PCR反应:
n (1)
• X=X * 2
0
• 非理想的PCR反应:
• X=X (1+Ex)n (2)
0
• n:扩增反应的循环次数
• X:第n次循环后的产物量
• X0:初始模板量
• Ex:扩增效率
定量原理
PCR反应进入指数扩增期:
XCt= X0 (1+Ex)Ct =N (1)
X :荧光扩增信号达到阈值强度时扩增产物的量.
Ct
方程式(1)两边同时取对数得:
logN =logX (1+Ex)Ct (2)
0
整理方程式(2)得:
log X0= - log(1+Ex)*Ct+ logN (3)
浓度的对数与循环数呈线性关系,根据样品扩增
达到域值的循环数计算出样品中所含的模板量
荧光化学
• 扩增序列不特异结合 SybrGreenI
• 扩增序列特异结合
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