中华大学生物资讯学程规划及学研合作经验.pptVIP

中華大學生物資訊學程規劃及學研合作經驗 規劃緣由 生物資訊(Bio-informatics)已是二十一世紀全世界科技研究最重要的課題之一 配合中華大學現有教學及育成資源，積極投入生物資訊人才培育 結合生物科技產業發展─形成產學共生效應 配合竹科生技環境創造學校特色形成聚落群益 規劃目標 以資訊工程為主體並結合生物科技之訓練，規劃生物資訊學程，讓國內廣大之工程人才經由學程之訓練即可成為生物科技產業之專門人才 成為國家未來發展生物科技中最有特色之重點學校之一 執行方法 人才培育 大學部： 生物資訊學程 研究所： 生物資訊組 學研合作 於民國90年與台灣動物科技研究所簽訂人員交流及研究計畫合作同意書 資工系專任師資(25+2) 資工系專任師資(續) 資工系專任師資(續) 資工系專任師資-生物資訊(續) 生物資訊學程動科所兼任師資 生物資訊學程規劃 (大學部 : 24學分) 生物資訊組規劃 (研究所 : 24學分) 生物資訊學程成果 (九十學年度修課人數) 生物資訊學程成果 (九十一學年度上學期修課人數) 研究所生物資訊組成果 九十一學年度開始招收10名碩士班研究生 其中7名為資工系畢業，3名各為陽明醫學系、中興動物系、東海畜牧系畢業 生物資訊研究方向 研究方向分四大主軸 生物資訊計算法研究 生物資訊知識庫研究 3D視覺化計算及醫學影像處理研究 生物晶片設計 生物資訊計算法研究 生物資訊計算演算法 DNA序列分析 基因認定 演化樹建構 蛋白質三維結構推測 生物資訊計算法研究 硬體環境的架構 PC叢集：利用16台單AMD 1.6G CPU，組合成具有平行計算能力的多處理器系統。 叢集伺服器：利用1台雙AMD 1.2G CPU，管理PC叢集平行系統。 高速網路：PC叢集配置10/100M網路卡，利用24 端10/100M交換式，連接伺服器。 伺服器配置10/100/1000M網路卡，利用12 端高速10/100/1000M交換式，連接資料庫及網際網路。 生物資訊計算法研究 軟體環境的架構 作業系統平台：Linux RedHat 7.1 程式編譯器：GNU C/C++/Fortran 叢集管理系統：XPBS 平行計算軟體：MPI及 XPVM 生物資訊知識庫研究 發展大儲存系統- Storage Acessed Network (SAN) 用PC叢集，發展平行資料庫電腦系統 用公開程式碼，發展軟體工具 建構大型Web/FTP 伺服器，用 Linux Virtual Server（LVS) 生物資訊知識庫研究 收集現有DB現況 生物資訊知識庫研究 UNI-BIO DB 現況 3D視覺化計算與醫學影像處理 研究方向 應用3D視覺化計算方法進行蛋白質比對及製藥分析 CT及MRI醫學影像立體重建與病變特徵辨識及量化(indexing) 生物晶片設計 生物晶片 基因晶片(GeneChip, DNAChip, Microarray) 蛋白質晶片(Protein Chip) 微流體晶片(Microfluidics) 實驗室晶片(Lab-on-a-chip) 初步成果 完成大學部生物資訊學程之規劃，並於九十學年度起開始開課 完成研究所生物資訊組之規劃，並於九十一學年度開始招收生物及資訊專長之學生(第一次招生有醫學系之學生報考) 完成大學部生物資訊學系之課程規劃，並將於九十二學年度起開始招生 初步成果 完成三十二個點之PC叢集系統之建置 完成部份基因及蛋白質資料庫系統之建置 獲得國科會生物與資訊工程教育整合計畫補助，共申請到三年經費伍佰柒拾萬元整，計畫已從九十年十月開始執行。(開始撰寫國內第一本「生物資訊」課程教科書) 獲得國科會提昇私校研發能量計畫-高效能生物資訊系統之建構補助，第一年申請經費共肆佰參拾餘萬元，已於九十一年八月開始執行。 初步成果 與台灣動物科技研究所共同向農委會申請「豬繁殖力功能性基因組解析及生物晶片之研發與應用:熱帶豬學生物資訊中心之建置」計畫己獲通過，共申請到第一年經費壹仟陸佰餘萬元整，計畫已從九十一年一月開始執行。 加入台灣大學向教育部申請「生物資訊跨校研究中心」計畫，成立生物資訊協同實驗室。 未來目標與展望 二年內建置完成六十四個點之PC叢集系統及軟體程式工具，並提供國內外其他研究機構高速生物計算及工具程式需求之服務。 二年內建置完成基因及蛋白質知識庫及資訊探勘技術，並透過網際網路提供國內外生物科技研究者資訊服務。 未來目標與展望 成立生物資訊研究中心，以做為學校中長程發展之特色 二年後申請大型之生物科技產學合作案 * * 鄭藏勝 中華大學工學院 大學校院工程及技術學院校院長會議 中華大學 生物資訊 育成中心 (新竹市) 台灣動物科技 研究所 (竹南) 園區