鱼类microRNAs研究进展.pdfVIP

第32卷第1期 水 产 科 学 V01．32No．1 2013年1月 FISHERIESSCIENCE Jan．2013 鱼类microRNAs研究进展 唐雪莲1，李 洪2，付京花1 510642) (1．华南农业大学动物科学学院，广东广州510642；2．华南农业大学兽医学院，广东广州 关键词：鱼类；microRNAs；进展 中图分类号：Q522 文献标识码：C 文章编号：1003·iiii(2013}01—0055—04 1．1 Mirbase数据库中收录的鱼类 MicroRNA(miRNAs)是一类内源性的长度约 22个核苷酸的非编码小分子RNA。miRNAs在线 虫、果蝇、植物、哺乳动物等生物中广泛存在，参与 基因转录后水平的调控，是基因表达、修饰、转录和 的一些保守的miRNAs，其中包括斑马鱼。之后， 翻译的调节者，在生物体胚胎形成、组织器官发育、 细胞分化凋亡、免疫功能调控及疾病发生等的各种 生命活动过程中发挥着重要作用。鱼类是重要的 脊椎动物，地球上现存鱼类超过3万种，约占地球 上脊椎动物总物种的50％[1]，相比之下，鱼类217种。基于生物信息等其他方法预测斑马鱼基因 miRNAs方面的研究相对落后。斑马鱼(Danio组编码的miRNAs超过400种[6]。 rerio)等作为模式生物，其miRNAs的研究较早。Mirbase数据库中收录的红鳍东方纯、绿河纯 近年来，miRNAs在其他鱼类体内的研究也取得了 miRNAs几乎都是基于斑马鱼的基因序列通过生 较大进展。目前鱼类miRNAs的研究水平主要集物信息方法预测而得到的[7]。青鳝鱼也是脊椎动 中于miRNAs的表达鉴定及新miRNAs的寻找与 鉴定，所研究的鱼的种类也仅限于十几种，关于 miRNAs的功能方面的研究较少。笔者就鱼类 SOLID 进行了研究，其后Li等[11]采用新一代ABI miRNAs研究进展进行综述，以期为更多的了解鱼基因测序平台发现和鉴定miRNAs，结果发现了 类的miRNAs及其在鱼类生长发育、不同生理过程 和疾病防御中的作用提供参考。 码593和425种成熟miRNAs。 1．2 Mirbase数据库中未收录的鱼类 1鱼类miRNAs的寻找及鉴定 截至2012年3月2日，关于miRNAs的专门数他鱼类miRNAs的研究也有很大进展。 据库(http：／／www．mirbase．org)收录的miRNAs条 目包括168个种属，愈18226条，其中鱼类的 miRNAs只有5个物种，包括斑马鱼344条，红鳍东 方纯(Fugurubripes)131条。绿河纯(Tetraodon他还在尖吻鲈(Lates nigroviridis)132条、青锵鱼(Oryziaslatipes)168 条。除miRNAs数据库收集的鱼类的miRNAs外， 近年的文献报道了人们对多种鱼类miRNAs的PCR扩增和测序的方法，发现尖吻鲈的63种新 研究。 收稿日期：2012·03-12；修回日期：2012—05—02． 金资助项目(2009K004，2008K002)． cn． 万方数据 水产 科 学 第3Z卷 miRNAs是10～86个物