实验一_分子结构优化计算.pdfVIP

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实验一 — 分子结构优化计算 要求: 1. 熟悉Chem3D软件 2. 掌握分子结构的绘画方法 3. 掌握分子结构的最优化和调整技巧 4. 了解复杂分子结构的绘画 实验一 — 分子结构优化计算 内容: 1. 建模— 几种分子结构输入的方法 2. 处理— 加氢饱和价键; 加电荷 3. 优化— 分子结构参数的最优化 4. 合理化— 分子结构确定 实验一 — 分子结构优化计算 步骤1: 建模的三种方式 分子式输入直接建模 实验一 — 分子结构优化计算 总结限制规则: 步骤1: 建模的三种方式 • 简单常见分子 • 区分大小写 分子式输入直接建模 • 总是取价键结构 • 与分子式写法有关 输入 CO, CO2, NO2, NO3, C2N2 • 可以同时输入多个分子 C2H6, CH3CCl3, C3H6, C3H4 C6H6, C6H5OH, C10H8 HCOOH, CH3OH, CH3COCH3, CH3COOCH3, NH2CH2COOH, C2H5NO2 H2SO4, HNO3, H3PO4, H2CO3 问题1-1. 对于红色标记的分子, 怎样获得正确的结构? 实验一 — 分子结构优化计算 步骤1: 建模的三种方式 化学键建模 默认是C原子! 单键 双键 三键 虚键 实验一 — 分子结构优化计算 步骤1: 建模的三种方式 化学键建模 单键 碳链 碳环 实验一 — 分子结构优化计算 步骤1: 建模的三种方式 化学键建模 问题1-2. 画“三键链” 的结果是什么? 问题1-3. 画出多个联苯环的共轭结构. 双键 双键链 三键 单双键交替 成环 自动共轭 实验一 — 分子结构优化计算 步骤1: 建模的三种方式 化学键建模 可以用字符输入改变原子 点击要改变的原子 输入目标元素 实验一 — 分子结构优化计算 步骤1: 建模的三种方式 化学键建模 可以改变键级 选中要改变的键 点击鼠标右键 或用快捷键

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