蛋白质间相互作用研究技术进展.pdfVIP

蛋白质间相互作用研究技术进展 田　云 　卢向阳 (湖南农业大学理学院 湖南长沙 410128) 　　摘要 　蛋白质组是后基因组时代出现的一个新兴研究领域 ,而蛋白质间相互作用的 研究是蛋白质组研究的一个重要方面 。简要介绍了蛋白质间相互作用的研究手段及最新 进展 。 　　关键词 　酵母双杂交系统 　噬菌体展示 　表面等离子体共振 　蛋白质芯片 　生物信 息学 ) 　　随着大量 DNA 序列数据的不断涌现 ,人们开始意 因子 的DNABD 序列 ,常用的转录激活结构域基因有 ( ) 识到仅仅依靠基因组的序列来阐明生命现象是远远不 GAL4 768～881 和疱疹病毒 VP16 的编码序列等 。最 够的。因为生命功能的物质基础是蛋 白质 ,且基因与 近 ,Peter 等人在酵母双杂交技术的基础上 ,设计了两种 蛋白质之间并不存在严格的一一对应线性关系 。1994 筛选策略以对酵母体内蛋白质相互作用进行了研究 。 ( ) 年 ,澳大利亚学者 Wilkins 和 Williams 首次提出了蛋 白 一种是阵列筛选法 Array screening ; 另一种是文库筛 ( ) ( ) 质组 Proteome 一词 。现阶段蛋 白质组的研究已经成 选法 Library screening 。这两种筛选法相比之下 ,前者 为了生物技术的一个重要领域 ,并形成了一门新的学 更为有效 ,而后者具有通量大的优点 。 ( ) 科 ———蛋白质组学 Proteomics 。蛋白质组学是在蛋白 1. 2 　酵母双杂交系统的特点及其改进 　酵母双杂交 质水平上的动量 、动态 、整体性地研究生物体 ,不是一 系统在检测蛋白质之间相互作用时具有敏感 、简洁 、真 个封闭的、概念化的、稳定的知识体系 ,而是 旨在阐明 实 、广泛等优点 。因此 ,许多蛋白质之间的相互作用都 生物体全部蛋白质的表达模式和功能模式的领域 。而 是用酵母双杂交的方法来分析的 ,如 RAPL 与 RIF1 等 。 蛋白质组功能模式的研究目前主要集中在蛋白质间相 该技术现已广泛应用于信号转导 、蛋白质功能、癌基因 互作用的网络关系上 ,现在作为研究蛋白质之间相互 研究、细胞凋亡研究、绘制蛋白质相互作用图谱及药物 作用的方法也比较多 。本文拟对这些方法及其进展作 设计等领域 。 一简要评述 。 同时酵母双杂交系统在研究蛋白质间相互作用时 1 　酵母双杂交系统 存在有一些明显的缺陷 ,其中有两个是不容忽视的:一 1. 1 　酵母双杂交系统的原理 　酵母双杂交系统又称 个是“假阳性”问题 。由于某些蛋白质本身具有激活转 蛋白阱捕获系统 ,是由 Stanley Fields 和 OKkyu Song 等 录功能或在酵母内表达时的转录激活作用 ,使靶蛋白 人于 1989 年根据真核转录调控的特点创建的。近几 BD 融合基因与诱饵蛋白AD 融合基因表达产物无须特 年来 ,该方法成了研究蛋白质间相互作用的一种非常 异结合 ,就能启动转录系统 ,产生假阳性结果 ; 另外一 有效的分子生物学方法 。 个问题是所分析的可能相互作用的蛋白