基于几何学习肿瘤分型研究.pdfVIP

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第27卷增刊 哈尔滨工程大学学报 V01.27 suppl. 2006年7月 JournalofHarbin Jul.2006 EngineeringUniversity 基于几何学习 的肿瘤分型研究 曹文明1一,丁立军1 摘要:将几何学习方法应用于肿瘤的分型.按传统处理方法对肿瘤基因表达谱数据预处理,选取特征基因;再应用几何学 习方法将样本中的特征基因表达水平数据构造已知类的空间几何凸胞,然后应用分型识别算法对待分型样本进行分类.并将 该方法应用于公开发表的白血病基因表达谱数据集的分型研究,取得100%分型准确率,此外,将几何学习的分型模型与支 撑向量机比较,实验结果证明该方法具有有效性与可行性. 关键词:基因表达谱;肿瘤亚型:几何学习;凸胞 中图分类号:R733.7文献标识码:A 文章编号:1006.7043(2006)增一0443-05 Researchon classificationbasedon tumor-subtypes geometricallearning 1 CAO Wen—ming‘…,DINGLi-jun (1.Institute Information ofIntelligent College,ZhejiangUniversityofTechnology,Hangzhou310014,China; System,Information 2.Instituteof of 100083,China) Semiconductors,ChineseAcademySciences,Beijing Abstract:Theaccurateclassificationof isof toclinicandmedicinal tumor-subtypesgreatsignificance is to and fortumorsortheir amethodof classifying subtypes.Thispaperproposes geneexpressiontechnologyapplieddiagnosing ordertoselect tumors classificationfor basedon feature tumor-subtypesgeometricallearning.Firstly,in genes,the genesexpression dataare totraditional thefeature datainthe are method;then pretreatedaccording processing genesexpression trainingsamples construedconvexhullsofe

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