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DNA甲基化数据分析方法和软件应用.pdf

重庆医学 年 月第 卷第 期 Z01Z 6 41 17 1719 技术与方法 DNA甲基化数据分析方法和软件应用 s 1Z 3 1 1 1 1 1 付利娟 s夏映曦 s何俊琳 s刘学庆 s陈雪梅 s王应雄 s丁裕斌 # (重庆医科大学: 公共卫生学院; 中医药学院 ; 重庆江陵医院 ) 1. Z. 4000163. 4000Z1 ! ! 摘 目的 分析DNA甲基化芯片实验过程质量控制方法\数据统计分析要点及实验结果的验证和数据的可视化处理D !! ! ! 方法 利用文献\ 甲基化实验数据探讨 甲基化研究中的方法学D结果 甲基化芯片初筛异常过程应多在步骤质 DNA DNA DNA ! ! 量控制工作中s包括DNA片段化\免疫共沉淀阳性对照的选择\去除原始扫描噪音信号和数据均一化处理DDNA甲基化芯片的 结果可采用常用的甲基化特异性 ( )和甲基化测序 ( )s引物设计软件包括 和 PCR MSP PCR BSP Meth rimer MethlPrimerEX- p y D 甲基化芯片分析数据的可视软件为 ; 结果的可视化可采用 系统下的执行软件 和 ress DNA Sinalma BSP Windows CUMA p g p BISMAD结论 DNA甲基化研究s应从多角度控制实验的设计和数据的产生及结果的分析D ! 关键词 甲基化;软件;质量控制;数据分析 DNA 文献标识码 文章编号 ( ) doi10.3969 .issn.1671- 34 .Z01Z.17.01 A 1671- 34 Z01Z17-1719-03 Dataanalsisanditsanalticalsoftsa licationonDNA methlationintumorresearch y y pp y 1Z 3 1 1 1 1 1

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