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甘蔗茎全长cDNA文库构建及EST序列分析_刘金仙.pdf
热带作物学报2013 ， 34 （3 ）： 480-485
Chinese Journal of Tropical Crops
甘蔗茎全长cDNA 文库构建及EST 序列分析
*
，
1 2 2 2 2 2
刘金仙 阙友雄 郭晋隆 许莉萍 陈如凯
， ， ， ，
1 武夷 学院茶 与食 品 学院 ， 福 建武夷 山 354300
福 建 农 林 大 学
2 福 建福 州 350002
农业部福 建甘蔗 生物学与遗传 育种重点实验室
摘 要 在利用改进的 法构建 个高质量的甘蔗茎全长 文库基础上 对该文库进行大规模
Oligo-capping 1 cDNA ，
测序 获得了 条 端有效 序列 平均长度为 经聚类和拼接获得 个假定独立转录本
， 283 5′ EST ， 459 bp ， 204 （TUTs ），
冗余序列所占比例 ％ 同源比对分析结果表明 其中 条 拼接的 个 与已知功能基因
27.9 。 NCBI ， 132 EST 103 TUTs
具有较高的同源性 结合拟南芥功能基因分类标准对这些 进行分类 可分为 类 以参与蛋白质合成的
， ， ，
TUTs 12
基因最多 其次为细胞结构 蛋白质降解和贮藏 转录等类型的基因
， 、 、 。
关键词 甘蔗茎 全长 文库 表达序列标签
； cDNA ； （EST ）
中图分类号 S566.1 文献标识码 A
Construction of Full-length cDNA Library from Sugarcane
Stem and the Corresponding EST Analysis
1,2
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