嵌入式生物计算系统研究.pdfVIP

信息科学与工程技术 和进一步简单的开发，就能创造出许多更快捷的设计方法。让我们继续努力，去挖掘发现计算机许许多 多的神奇功能，把我们的工作做得更好。 最后，诚恳希望大家对本文的缺点和不足提出批评、指正，希望更高新的技术得到交流，为进一步 提高科技创新能力、振兴老工业基地、发展现代装备制造业做出更大的贡献。 作者简介 阳鼓风机集团技术中心工艺部、工装设计室高级工程师。主要科技成果有：多用铣头、新型减速装置、高精度双模架浮动式 组合冲模等。在国内刊物《机杏妨、《工具技术》、《饥械工人》、 《机床维修与改装》中发表过科技成果及论文，曾获得省、 市科协优秀论文奖。 嵌入式生物计算系统的研究 宋纯贺 蔡巍赵海 朱鹏 高洁 龚红艳韩叙东 祁田宇 (东北大学信息科学与工程学院嵌入式实验室) 摘要：生物计算机的成熟与发展，是继电子计算机之后科学技术发展的又一里程碑，将使人类的生活方式 发生根本性的变革，同时也为未来几十年内经济发展提供了前所未有的机遇。但单纯的生物计算技术有其固有的 局限性，使其停留在研究阶段难以产业化。本文针对传统冯诺依曼体系计算机在并行计算能力方面的不足，以及 目前生物计算技术存在的弊端，提出了嵌入式生物芯片技术的设计思想，并给出了其框架设计方案。系统级嵌入 式生物计算芯片技术，依托传统嵌入式技术，将生物计算和电子计算技术有机结合，对比单纯的生物计算技术更 具可行性和实用性。发展嵌入式生物计算技术，不仅能够推动老工业基地的科技水平，更重要的是将带动诸如微 电子技术，生物技术，材料科学以及周边产业迅速发展。 关键词：生物计算嵌入式技术系统级芯片 简单逻辑并行问题DCL语言 世纪之初，人类正面临着迅猛的信息技术的挑战和机遇，其中生物计算技术就是以生物技术为要素 的一场计算技术的革命。2l世纪是生物技术的世纪，基因组计划、基因工程、细胞工程、酶工程、蛋白 质工程将带来农业、食品、医药和化工等领域的革命，产生难以估量的社会效益和经济效益。生物技术 的飞速发展及其广泛的应用前景，将使生物产业成为全社会的产业支柱。 在生物技术的发展中，生物计算机的成熟与发展，将对人类生活方式产生巨大影响，同时在未来几 十年也将极大的推动相关产业和经济的发展。目前采用的硅芯片上集成的电子器件数量已逐渐接近极限， 电子计算机的计算处理能力已经接近极限。以DNA计算机为首的生物计算机将会成为传统计算机的理想 的终结者。各种生物计算机将彻底实现现有计算机所无法真正实现的模糊推理功能和神经网络运算功能， 是模拟人工智能的一个突破口。但是，DNA计算机有其特定的局限性，如处理简单逻辑问题和算术问题 时的复杂性，以及DNA计算系统处理计算问题的多用性和有效性…等。本文提出将生物计算系统与电子 计算系统相结合，构成嵌入式生物计算系统，发挥了生物计算和电子计算的各自优势。 一、DNA计算概述 1994年美国南加州大学Leonard 行简单的生物操作解决了一个经典的数学问题一Hamihon路径问题，开创了DNA计算的新纪元。 进行编码。DNA计算过程可以表述为，在适当的生化反应环境中，需要时可在特定生物酶的作用下，根 165 科技创新与和谐社会建设 据一定的规则将原始问题的数据运算并行地映射为DNA分子链的可控生化过程，最后利用生物分子技术 如集合酶反应PCR、聚合重叠放大技术POA、超声波降解等技术识别运算结果。 DNA计算具有以下几个特点： 1．计算过程是并行的，计算运行速度陕。 2．数据密度高，工作能耗低，抗电磁干扰能力强。 二、嵌入式生物计算系统结构体系设计 (一)DECoc框架设计 算和简单数学运算；DCoc负责处理特定的一类数学计算问题——简单逻辑并行问题SLP(具体定义在3．1 中给出)。DECoc系统结合了电子计算系统和DNA计算系统的优点，扩展了片上系统的计算能力。 片上DNA电子计算系统DECoc 电子计算系统ECoc DNA计算系统DCoc