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生物信息学数据库NCBI的检索与利用
何晓薇
浙江大学图书馆咨询部
xwhe@
2009-10-15
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
摘 要
生物信息学数据库的分类
NCBI
概况
NCBI的检索和利用
(GenBank/PubMed/MyNCBI/Blast)
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
生物信息学数据库的分类
核酸序列数据库
蛋白质序列数据库
蛋白质结构数据库
基因组数据库
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
核酸序列数据库
欧洲分子生物学实验室的EMBL
http://www.embl-heidelberg.de
美国生物技术信息中心的GenBank
/Genbank/
日本国立遗传研究所的DDBJ
http://www.ddbj.nig.ac.jp/searches-e.html
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
国际上最权威的核酸序列数据库
国际核酸序列数据库
合作组织
数据每天交换
Accession number 、序列数据和注解相同
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
蛋白质序列数据库
SWISS-PROT 蛋白质序列数据库
http://www.expasy.ch/sprot/sprot-top.html
PIR 蛋白质序列信息资源库
/
PROSITE
/prosite/
NCBI 蛋白质数据库
/entrez
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
蛋白质序列数据库
European Bioinformatics Institute
The Universal Protein Resource
Protein Information Resource
/
Swiss Institute of Bioinformatics
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
蛋白质结构数据库
PDB 蛋白质数据仓库（Protein Data Bank）
/pdb/
SCOP 蛋白质结构分类数据库（Structural classification
of proteins ）
http://scop.mrc-lmb.cam.ac.uk/scop/
生物信息学数据库NCBI的检索与利用
蛋白质数据库
Expert Protein Analysis System
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