生物探针纳米力学行为的连续介质力学模型.pdfVIP

—— 塑垡堑堂塑塑堂!型坠坚! 生物探针纳米力学行为的连续介质力学模型+ 张能辉1’2郑晋2 (1上海大学，上海市应用数学和力学研究所，上海200072) (2上海大学理学院力学系，上海200436) 摘要以无标定生物检测引起探针的挠度为未知量，建立模拟生物探针纳米力学行为的连续介质力 学模型．在生物化学作用引起的表面应力作用下，比较采用单层硅粱模型和层合粱模型预测探针挠度的差别； 在均匀温度场作用下，研究生物层对探针变形的影响． 关键词生物探钟，表面应力，层合悬臂粱，均匀温度场 引言 目前DNA芯片技术中生物信息的检测和读取大多采用荧光标记法，利用扫描同焦显微镜 读出杂交点的荧光信号强弱，它的优点是重复性好，缺点是成本高、灵敏度低．因此，科学家正在 研究多种替代方法，如质谱法、化学发光和光导纤维、二极管方阵检测、乳胶凝集反应、直接电荷 变化检测等．最近科学家正在探索一种基于微米级悬臂梁光学挠度检测技术的无标记生物检测 方法““]，其工作原理是利用DNA杂交时引起的探针力学响应提取生物信息．由于采用AFM读 出探针挠度，靶分子无需标定，所以该方法灵敏度高、成本低、速度快．然而目前大部分工作是采 用实验方法研究生物探针的纳米级弯曲运动机理，有关这方面的定量研究还不多见． 本文以探针的挠度为未知量，建立了模拟生物探针的纳米力学行为的连续介质力学模型． 在生物化学作用引起的表面应力作用下，比较了采用单层硅梁模型和层合梁模型预测探针挠 度的差别j在均匀温度场作用下，研究了生物层对探针变形的影响． 1连续介质力学模型 1．1杂交表面应力情况 实验口~61表明，探针的纳米级弯曲运动与缓冲溶液的离子浓度、ssDNA的打印密度和长 的靶分子杂交的程度大约有60％～80％，因此Fritz[13认为这种纳米运动是由于生物分子配对 引起的表面应力造成的． *国家自然科学基金资助课题(批准号和上海市重点学科资助课题 ·343· 图i生物探针的几何示意图和受力图 DNA芯片是由四层材料组成的悬臂粱结构．DNA芯片长度￡，宽度b，每层材料的厚度、 弹性模量和热膨胀系数分别为h：，E，，q，i=0，1，2，3分别代表ssDNA、金、钛、硅层．沿梁纵 向对称面与中性层分别建立Y轴和z轴．设层合梁的中性层离硅层上表面的距离h，作用在探 针上的杂交表面应力的集度为q．实验““o表明，探针的最大挠度一般为o～80nm，探针长度 一般为200～500／*m，因此，可采用梁的小挠度理论来模拟探针的弯曲行为．若规定梁的挠度 w(z)向上为正，不难得到杂交表面应力作用下生物探针层合梁模型为 (1) 叫”=(一丢掣2+掣士一i1掣2)／(Ef)，硼(o)=o，训’(o)一。 式得，生物探针的最大挠度值为I”。。(z)I一掣4／(8口)．由于ssDNA层、金层、钛层与硅层相 比非常薄，可以忽略生物层和金属薄层对探针变形的贡献，因此不妨将四层梁模蛩(i=0，1， 2，3)简化为单层硅梁模型(f一3)，而由单层硅梁模型预测的探针最大挠度值为IW。(z)I= 面4／(8E3L)． 由于缺乏ssDNA层的力学性能实验数据，层合梁模型中暂不考虑ssDNA层对探针弯曲 变形的贡献，仅比较三层梁模型(i一1，2，3)和单层硅梁模型预测探针最大挠度值的差别． btm和材料参数 由探针的几何参数l=500pm，b一100pm，h1=2011111，h2—2nln，h3=1 E一81GPa，E2—108Gpa，E一160Gpa计算得到，由两种模型预测探针的最大挠度值相 对误差为3．55％，这说明金层和钛层几乎不承担探针的弯曲变形，即探针的弯曲变形主要由 硅层承担．于是由单层硅梁模型可以预测，探针上表面应力的载荷集度近似公式为q一 8E3J。IW(D(z)I／￡4．