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- 2017-08-18 发布于江西
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生物信息学分析上机实验教学大纲.doc
生物信息学分析上机实验教学大纲
一、制定本大纲的依据
依据《生物信息学分析教学大纲》制定本上机实验大纲。生物信息学是一门新兴的交叉学科它所研究的材料是生物学的数据,而它进行研究所采用的方法,则是从各种计算技术衍生出来的。随着基因组研究的深入进行,生物信息学也得到了飞速的发展。学会常用生物信息数据库查询数据库搜索方法序列分析和分子进化分析软件的使用方法
二、本实验课程的具体安排
实验项目的设置及学时分配
序号 实验项目名称 内容简介 实验学时 实验要求 实验类型 实验类别 每组人数 1 常用分子生物学数据库的使用 以生物信息学的各大门户网站其中的一个信息中心网站为例,列举其中的主要生物信息资源 2 必修 综合 专业 2 2 DNA序列的统计学、信息学和功能分析 使用NCBI或Sanger Center的基因组图谱浏览器查看基因组数据,利用在线工具进行开放阅读框的识别及基因编码区的预测。 2 必修 综合 专业 2 3 蛋白质序列分析和结构预测 读取NCBI的蛋白质序列数据,运用Rasmol或CN3D软件观察蛋白质的三维结构以及蛋白质二级或三级结构的预测。 2 必修 综合 专业 2 4 核酸和蛋白质序列的进化分析 选择BLAST方式及各种参数,对数据库中核酸和蛋白质序列进行遗 传发育关系的进化分析。 2 必修 综合 专业 2 5 常用重要生物信息学软件使用方法 学习DNAToo
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