基于iTRAQ定量蛋白质组学技术的鸭疫里默氏杆菌差异蛋白质组学研究.pdfVIP

中国畜牧兽医学会畜牧兽医生物技术学分会暨中国免疫学会兽医免疫分会第十次学术研讨会论文集 基于iTRAQ定量蛋白质组学技术的 鸭疫里默氏杆菌差异蛋白质组学研究 袁建丰+，李林林，孙敏华，董嘉文，向 荣，胡奇林 (1．广东省农业科学院动物卫生所，广东广州510640；2广东省兽医公共卫生公共实验室，广东广州510640) 病原菌的致病作用是多种毒力因子参与下的病原菌- 在本研究中，根据预实验结果确定了螯合剂浓度和铁 宿主相互作用的动态过程。一般来说，由于环境条件的显 离子浓度，共设四组实验组，分别为A：50ltM(FeCI，)， B：对照组，C：10 著差异，病原菌在体内外所表达的蛋白质是明显不同的， ttg／mL(螯合剂)，D：20ttg／mL(螯合 我们相信这些差异表达的蛋白质与病原菌的致病作用密切 剂)，四组样品组分别设一对平行照组。经蛋白定量统计 及生物信息学分析，共获得25 相关。因此，研究病原菌致病相关的蛋白质差异表达谱， 430个Spectra(谱图数量)， 对于阐明病原菌的致病机制以及寻找潜在的药物靶标和疫 25366个UniqueSpecra(匹配到特有肽段的谱图数量)， 苗靶分子具有非比寻常的意义。 6 058 129个Peptide，6119个UniquePeptide(特有肽段)，l 本研究小组在前期的研究工作中发现铁离子是鸭疫里 默氏杆菌重要的生长因子，能调控该菌毒力因子在宿主体 个蛋白质下调表达；A／C：37个蛋白质上调表达，48个蛋 内的特异性表达，对鸭疫里默氏杆菌的致病作用起着至关 白质下调表达；A／D：46个蛋白质上调表达，23个蛋白质 重要的作用。基于上述研究结论，本项目拟在体外营造限 下调表达；B／C：44个蛋白质上调表达，50个蛋白质下调表 铁环境来模拟病原菌体内感染条件，采用自动化、高通量 达；B／D：41个蛋白质上调表达，35个蛋白质下调表达； 的iTRAQ鸟枪法蛋白质组学技术对限铁和丰富铁环境中C／D：31个蛋白质上调表达，15个蛋白质下调表达。此外， 鸭疫里默氏杆菌蛋白质组进行比较分析，以期寻找新的、 针对鉴定出的所有蛋白进行GO功能注释分析和COG功 潜在毒力因子，并建立与鸭疫里默氏杆菌致病作用相关的 能分类统计。同时，通过KEGGPathway分析确定了蛋白 蛋白质组。 质参与的最主要生化代谢途径和信号转导途径。 农业科学院院长基金(201015、 作者简介：袁建丰(1978·)，男，江苏宜兴人，副研究员，博士，主要从事病原细菌学研究． }通信作者：E-mail：jfeng．yuan@gmail．eom 一357—