HIV-1CRF_07BC重组型逆转录酶区耐药进化通路分析.pdfVIP

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HIV-1CRF_07BC重组型逆转录酶区耐药进化通路分析.pdf

主堡亟堕匿堂盘查!Q!垒生生旦筮堡鲞筮!塑£!也』里丝!丛塑:△P堕!!!!垒:!!!:堡:塑!:兰 ·30l· .论著. HIV一1 CRF_07 BC重组型逆转录酶区耐药 进化通路分析 李臻鹏 黄洋 欧阳雅博邢辉廖玲洁 邵一鸣 马丽英 【摘要】 目的探讨HIV-1的CRF_07BC重组型在药物压力下的进化通路,并与B亚型进行比 较。方法病毒样本来自2007--2011年新疆维吾尔自治区和四川省参加艾滋病多中心队列研究的 共862例AIDS患者。根据未治疗的588例和治疗的274例AIDS患者病毒样本的逆转录酶区序列, 采用选择压力的方法识别耐药相关位点,使用贝叶斯网络法构建CRF_07BC重组型在抗病毒治疗下 的耐药进化通路,同时利用国际HIV耐药数据库中的数据构建B亚型在相同治疗方案下耐药进化通 路,并与CRF__07BC重组型进行比较。结果 预测的CRF一07BC重组型主要耐药位点为K103N、 219E/Q)通路均存在于两个病毒类型中。不同于B亚型的是,预测的CRF_07BC重组型的主要耐药 位点中不包含TAM相关突变,并且在核苷类药物相关突变与非核苷类药物相关突变之间存在强的依 赖关系。结论HIV一1 CRF_07BC重组型形成了以K103N、Q197K、V179D和Y188L为主要耐药位点 的独特耐药进化通路,并与B亚型的耐药进化通路有较大差异。 【关键词】HIV;生物进化;CRF_07BC;耐药进化通路;耐药位点 Resistance ofHIV-1 Li CIuF—07BCreverse evolutionarypathwayanalysis transcriptaseZhenpeng. CenterAIDS/ Huang%昭,OuyangYabo,施昭Hui,LiaoLingjie,ShaoYiming,MaLiying.Nationalfor S功Controland DiseaseControfand P例ention,ChineseCenterfor Prevention.Beiiing102206.China Correspondingautho‘:Ma血,,i凡髯,Email:mal@chinaaids.cn To resistance evolution of under 【Abstract】0bjectivestudy HIV~CRF—BC pathway drug selection withB Basedonthereverse of subtype.Methods region pressure,andcompare transcriptase HIV一1from588treatment.naiveand274treatment basedmethodwas CRF_97BC patients.selectionpressure usedtoselectresistance.associated network to the

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