10微生物的分类鉴定及命名.pptVIP

本章内容提要 1 生物界的分类 2 微生物的分类学 3 分类单元和分类名词 4 微生物的命名 5 进化指针的选择 6 微生物分类鉴定的特征和技术 7 微生物的分类系统 教学提示： *重点掌握各分类单元名称、微生物命名原则 *了解微生物的进化地位和分类系统。 *难点是分类学的名词术语和常见常用微生物的拉丁文学名，但又是必须掌握的。要求掌握的较重要的常见常用微生物共约30个学名，希望同学们认真领会、记忆，这是回避不了的，是《微生物学》学习的基本功。 1、生物界的分类 生物的界级分类学说：在认识发展过程的不同阶段存在对生物分类的不同观点。 如：二界系统、三界系统、四界系统、五界系统、六界系统和三原界系统直至三域学说. 三原界系统是1978年由R.H.Whittaker和L.Margulis提出的。 所有生物存在一个共同祖先，由它分三条进化路线，就形成了三个原界：古细菌（Archaebacteria）原界、真细菌(Eubacteria)原界、真核生物(Eucaryotes)原界. 内共生学说——主要是L. Margulis的贡献. L. Margulis 的真核细胞共生起源假说 三原界系统 三域学说(three domains theory)及其 生物进化谱系树 微生物的进化地位： 通过放射性元素的计时技术，测得地球年龄约有45-46亿年。从最古老的微生物化石叠层岩中发现，类似细菌的生物在约35亿年前就已出现，此时地球开始由化学进化转入到生物进化阶段（此时为单极生态系，最早出现的生命形态主要是古生菌）； 发现蓝细菌类原核生物是在21亿年前,此时已进化到双极生态系统，并且地球大气开始由无氧变成有氧，并且开始有了阻挡紫外线的臭氧层，之后出现真核微生物； 大约6亿年前，水圈中出现了后生动物（摄食消费者），至此已形成了三极生态系；之后出现由“鱼—陆生生物—两栖类—爬行类”的进化趋势，人类诞生至今不过300万年。 有人认为，如果把地球年龄比喻为一年的话，则微生物诞生的时间是在3月20日左右，人类出现的时间是12月31日下午7时左右，所以可以毫不夸张地说，微生物是一切生物（包括人类）的“老前辈”。 模式种： 在微生物中，一个种只能用该种内的一个典型菌株（type strain）当其具体代表，此即该种的模式种（type species ）。 例如： 两歧双歧杆菌的大量菌株中，只有“ATCC29521”菌株才是模式种 型(form): 亚种以下的细分，仅作若干变异型的后缀使用. 当同种或同亚种内不同菌株之间的性状差异不足以分为新的亚种时，可以细分为不同的型。例如：按抗原特征的差异分为不同的血清型；另有形态变异型、致病变异型等 关于微生物的新种——新分离到并鉴定过的、从未记载过的微生物 新种命名： 按《国际命名法规》进行命名，并在规定的学术刊物上发表，而且应在其学名后附上 “sp. nov”符号。例如： Corynebacterium pekinense sp. nov AS1.299 当泛指某一属微生物而不特指该属中某一具体种时，或者还未确定种名时，可在属名后加sp.或ssp.（分别代表species 缩写的单数和复数形式）（用正体字打印）表示. 例如： Saccharomyces sp. 表示酿酒酵母属中的一(某)个种。 Saccharomyces spp. 表示酿酒酵母属中的一(某)些种。 Escherichia coli B 大肠杆菌B株 Bacillus subtilis AS1.398 枯草芽孢杆菌AS1.398菌株 AS1.*** Academia Sinica（中科院）对细菌类的编号 AS2.*** 酵母类 AS3.*** 霉菌类 AS4.*** 放线菌类 例： S. cerevisiae的常用菌株有： AS2.173 一株葡萄酒酵母 AS2.375 一株面包酵母 AS2.393 一株酒精酵母 AS2.14 一株啤酒酵母 AS2.4 另一株啤酒酵母 AS2.346 一株果酒酵母 ②三名法：用于对亚种的命名，这时在属名和种名后加写一个subsp (排正体），然后再附上亚种名称（排斜体）。 如： Bacillus thuringiensis （subsp） galleria 苏云金芽孢杆菌腊螟亚种 三域学说受到的挑战： 随着微生物的全基因组序列分析研究的深入，一些学者对Woese的学说提出了了质疑： 1） 16SrRNA或18SrRNA的分子进化很难代表整个基因组的分子进化； 2）已知许多真核生物的基因组和其表达的功能蛋白不象Woese所说的接近