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利用knockout和time series基因表达数据改善基因调控网络 报告时间：2013-12-27 Plos one | 提纲 基因调控网络简介 实验方法和模型 实验结果与评价 基因调控网络简介 提出 随着大规模基因组测序、基因预测以及注释的完成，生物学研究更加关注动态部分即基因调控网络。基因调控网络结构的改变是细胞分化和肿瘤生成等生物现象的深层原因。 基因调控网络简介 基因表达数据 基因表达数据：基因调控网络中最重要的部分是转录水平的调控。基因表达数据反映的是直接或间接测量得到的基因转录产物 mRNA在细胞中的丰度，这些数据可以用于分析哪些基因的表达发生了改变，基因之间有何相关性，在不同条件下基因的活动是如何受影响的。 基因调控网络简介 数据源 数据获取来源： DREAM（ Dialogue on Reverse Engineering Assessment and Methods ） project, DREAM3 Challenges. 数据类型： knockout、knockdown、 time series trajectories. 基因调控网络简介 Wild type Exp1(-G1) Exp2(-G2) Exp3(-G3) Exp4（-G4) … G1 0.5136 0.0051 0.8299 0.7489 0.1637 … G2 0.2674 0