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宁夏地区黄牛博尔纳病病毒自然感染状况的探讨_临床医学论文
宁夏地区黄牛博尔纳病病毒自然感染状况的探讨_临床医学论文
作者:马彦, 王振海, 孔繁元, 谢鹏
【摘要】 目的 了解宁夏地区黄牛博尔纳病病毒(Borna disease virus,BDV)的自然感染情况,对检测到的BDV p24基因阳性扩增片段进行核苷酸序列比对,探讨其与国际标准病毒株及其分离株的同源性。方法 采用荧光定量巢式逆转录酶聚合酶链反应(FQ-nRT-PCR)检测宁夏地区205例健康牛外周血单个核细胞(PBMCs)BDVp24基因片段,并对其中的阳性扩增产物进行基因序列测定,然后应用BLAST软件以及DNAsist 5.0 软件对测序结果分析。结果 205例中3例阳性,阳性率为1.5%;该BDVp24 片段的核苷酸序列与Strain H3915 同源性最高达97.67%,与标准病毒株 H1766同源性为96.51%,与Strain V/FR的同源性为95.35%,且它们编码的氨基酸相同。结论 宁夏地区黄牛中存在动物源性BDV的自然感染,该BDV p24核苷酸序列与标准病毒株具有高度同源性。
【关键词】 博尔纳病病毒;荧光定量巢式逆转录酶聚合酶链反应;牛外周血;宁夏
博尔纳病病毒(Borna disease virus,BDV)是非细胞溶解性的、负链、单股的RNA 嗜神经病毒。研究表明,BDV具有广泛感染宿主,可感染鸡、山羊、兔、驴、骆驼、羊驼、牛、狗、猫、驼鸟以及人等在内的几乎所有温血动物,并引发Borna 病(Borna disease,BD),临床表现为致死性中枢神经系统损害,以行为异常、脑实质和脑膜的炎性细胞浸润,以及疾病特异性抗原在边缘系统中积聚为特征。目前尚未见中国牛感染BDV的文献报道,特对宁夏地区黄牛进行了BDV感染的检测,现报告如下。
1 材料与方法
1.1 材料 205例健康成年黄牛均来自宁夏地区,每例取外周乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝血5mL。
1.2 方法 试剂和其它材料包括:Ficoll-conray液,Trizol RNA提取抽提剂(购自BioFlux),BDV p24荧光定量PCR检测试剂盒(购自广州达晖生物技术有限公司)。BDV p24基因扩增产物及探针序列:外引物P1为5’-TGACCCAAACCAGTAGACCA-3’(19bp),P2为5’-GTCCCATTCATCCGTTGTC-3’(19bp);内引物P1为5’-CCCTCCAAGTGGAAACCAT-3’(19bp),P2为5’-CAGTATCTTGATGTTCTCGCCA-3’(22bp);荧光探针为5’-FAM-TCAGCGGTGCGACCACTCCGATAGC-TAMRA-3’(25bp)。BDV重组质粒由重庆医科大学神经病学研究所提供。采集EDTA抗凝外周血各5mL,分别用Ficoll-conray液密度梯度离心法分离外周血单个核细胞(PBMCs),采用Trizol一步法提取细胞总RNA,标本置-80℃保存备用。然后进行(1)RNA完整性检测:采用1%琼脂糖凝胶(含溴化乙锭浓度为0.5%)电泳。取RNA样品5μL加样,以3~4 V/cm电压电泳25min,在凝胶扫描系统中观察结果并照相。(2)BDV质粒标准曲线制作:将重组质粒定量后作为阳性模板,稀释至107 、106、105、104、103 、102 拷贝·μL-1浓度梯度,于Roter-gene 6000型扩增检测仪上进行PCR扩增,由电脑自动分析出定量结果,并给出PCR扩增的动力学曲线。(3)FQ-nRT-PCR检测BDV p24基因片段(按照BDVp24荧光定量PCR检测试剂盒说明进行):首先进行逆转录反应,在含RNA的Ep管中加入7μL逆转录体系反应液Ⅰ,逆转录酶1μL,DEPC水7μL,总反应体积为20μL,于37℃ 持续1h;然后取逆转录产物5μL,加入反应液Ⅱ8μL,TaqDNA聚合酶1μL,去离子水11μL,反应体积为25μL,进行PCR第一步扩增:93℃4min预变性,94℃变性30 s,54℃退火30 s,72℃延伸1min,循环20个周期;再取PCR第一步扩增产物5μL,加入反应液Ⅲ 14μL,TaqDNA聚合酶 1μL,去离子水30μL,反应体积为50μL,进行PCR第二步扩增:93℃3min预变性,93℃变性45 s,55℃延伸60 s,共循环40个周期。每次实验均设阴性对照。(4)PCR扩增阳性产物的鉴定和序列分析:将BDV p24基因片段阳性PCR第二步扩增产物5μL加样,以2%琼脂糖110V电压60mA电流电泳35min,在凝胶成像系统中扫描并照相。可见与目的基因片段相同分子量大小86bp电泳条带。将BDV p24基因片段阳性的扩增产物送上海英骏生物技术有限公
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