猪EPLIN基因单核苷酸多态性的研究.pdfVIP

畜牧部分 125 猪EPLIN基因单核苷酸多态性研究 王恒李新云朱正茂杨述林牟玉莲冯书堂李奎 (中国农业科学院畜牧研究所北京100094) 摘要：猪m肼基因与仔猪跛腿的发生有关，本实验以大白猪、长白猪、五指山猪和通城猪近140十十体为材料，进 基因频率明显高于我国地方品种通域猪。 关键词：猪；砌基因；5NPo 近年来发现的EPuN基因，其翻译的蛋白是与细胞骨架有关的结构蛋白，EP皿q在大多数肿瘤细胞中 位于EPLIN基因第三内含子内的启动子转录而形成的m“，在猪中，EPLIN在跛腿仔猪的肌肉中表达量升 高，表明EPLIN蛋白可能与肌肉细胞的发育以及肌肉形态有一定的关系…。本研究在对EPLIN基因片段 测序的基础上，寻找合适的酶切位点，并在猪群中进行SNP检测。 1材料与方法 1．1材料 1．1．1试验猪群及DNA样品 试验猪群来自湖北省通城县畜牧局，采集血样后采用常规的苯酚一氯仿抽提法“1提取DNA，TE溶解， 一20℃保存。 1．2方法 1．2．1引物设计 Primer 1．0软件设计引物。该引物扩增片段长度为782bp，引物序列为 ForwardPrimer：5’一GAGAAAGAAGACAAGCCAGC一3’． Reverse Piililel7：5’一AcAccAcAcAAGATccc从G一3’，引物由上海博亚公司合成。 1．2．2PcR扩增 xBuffer 1．2t,L，lOpmolJL的两对引物 扩增体系组成：扩增总体系为2吣L，其中10 2皿，25mmollLMgCk dNTP mmol／L l止。反应程序 各o．4皿，10 O．2止，7砷DNA聚合酶(SU／pL)O．2皿，200ng／皿的基因组DNA 1．2．3酶切及电泳 37℃温箱中过夜，用1．5％的琼脂糖凝胶电泳，观察酶切结果，由带型判断基因型。 ＼ 2结果与分析 2．1 PCR产物测序及酶切结果 126 2006学术年会 没有引起氨基酸变化，用Ec024I酶切后电泳如图i，将基因型分别定为Tr、Tc和cc型。 图1 EPLJN基园3’L佣的PCR—RFLP电泳结果 2．2不同品种猪的基因型频率和基因频率 利用PCR—RnP方法对不同品种的个体进行检测后分型，统计出各种基因型的个体数，并计算基因 型频率和基因频率，其结果如表。从表中可以看出：长白猪中缺乏T等位基因频率较高，而通城猪中c等 位基因频率较高，而在五指山猪中没有检测到T等位基因。 3讨论 通城猪作为我国地方品种，生长速度较慢，有较好的脂肪沉积能力，而长白猪等引人品种生长速度 快、瘦肉率高，实验结果硅示，T等位基因在长白等外种猪中频率较高，而通城猪中C等位基因频率较高， 这可能与中外不同品种猪在生产性能上存在差异有关。有报道说跛腿仔猪在长白猪中发生的频率比其 他品种高引，但是是否与EPLIN基因的突变有关，还有待进一步研究。 参考文献 [1]MadItS，ChangDD，EPLIN，epit喇alproteinlostinneoplasm．Oneogenel999，18(54)：7838—7841 0f lostin Gerbin DDCharacterization RS．SachiC，Chang mouse印ithelialprotein neoplasm【EPLIN)andcolrl叫B∞of [2]Mad ⅡmImnah册andzebrafishEPLIN．C,ene2001．262：155～160 0f mu∞leofneonatal and a1．Isolation skeletal leg S，JaesertS，Neum