Biolog和PCR-DGGE技术解析椒江口沉积物微生物多样性.pdfVIP

第 32卷第 6期 环 境 科 学 学 报 Vo1．32．No．6 2012年 6月 ActaScientiaeCircumstantiae Jun．．2012 杜萍 ，刘 晶晶，沈李东 ，等．2012．Biolog和 PCR-DGGE技术解析椒江口沉积物微生物多样性 [J]．环境科学学报 ，32(6)：1436—1444 DuP，LiuJJ，ShenLD，eta1．2012．DiversityofmicroorganismsinsedimentsoftheJiaojiangEstuaryasestimatedbyBiologandPCR．DGGE[J]．Acta ScientiaeCircumstantiae，32(6)：1436-1444 Biolog和 PCR-DGGE技术解析椒江 口沉积物微生物 多样性 杜萍 ，刘晶晶 ，沈李东 ，胡宝兰 ，曾江宁 ，陈全震 一，寿鹿 ，廖一波 1．国家海洋局第二海洋研 究所 国家海洋局海洋生态系统与生物地球化学重点实验室，杭州310012 2．浙江大学环境S-程系，杭州310029 收稿 日期 ：2011-08—11 修回 日期 ：2011-09-18 录用 日期 ：2011—10—09 摘要：采用 Biolog和 PCR—DGGE技术对椒江口6个站位表层沉积物群落水平的微生物代谢功能和 以16SrRNA基因标记 的细菌遗传多样性进 行分析，并对其代谢功能和群落结构与沉积物污染物等参数进行冗余梯度分析 (Redundancygradientanalysis，RDA)和典范对应分析(Canonical correspondenceanalysis，CCA)．Biolog分析结果表明，微生物群落整体代谢活性 由高到低的顺序为：潮 问带 (B1、B2)、人海 口处 (A3)人海 口内 (A1、A2)人海 口外(A4)；碳源代谢的 Shannon—Wiener多样性指数范围为2．09—3．25，由高到低 的顺序为 ：潮间带 (B1、B2)、人海 口处 (A3) 河道 内(A1)近人海 口处 (A2)人海 口外 (A4)；潮间带 、人海 口处及河道内的微生物对各类碳源的相对利用率较平均 ，而近人海 口处和人 海口外的微生物群落对聚合物的相对利用率较高，对氨基酸类和胺类的相对利用率较低．DGGE图谱分析表明，细菌群落结构沿河 口盐度梯度 存在空间异质性 ，但两潮间带站位的相似度高(82．27％)；遗传基因的Shannon-Wiener多样性指数范 围为 1．68—2．87，由高到低 的顺序为 ：潮 间带 人海 口处 人海口外 近入海 口处 河道 内．群落代谢功能与理化 因子的 RDA显示 ，有机质和硝基苯的分布能较好地解释微生物群落 代谢功能的变化 ；群落遗传结构与理化因子的 CCA显示 ，硝基苯和多环芳烃 的分布能较好地解释细菌群落遗传结构 的变化．综上结果认为 ，椒 江 口沉积物的微生物代谢及遗传多样性符合典型的河 口特征，但人海 口内微生物沉积环境已表现出对某些化工污染物的响应 ． 关键词：Biolog；PCR—DGGE；椒江口沉积物 ；微生物代谢功能 ；细菌群落结构 ；多样性 文章编号：0253-2468(2012)06-1436—09 中图分类号 ：X171 文献标识码 ：A DiversityofmicroorganismsinsedimentsoftheJiaojiangEstuaryasestimated byBiologandPCR-DGGE DUPing，LIU Jingjing，SHEN Lidong，HU Baolan，ZENGJiangning，CHEN Quanzhen一，SHOU Lu ， LIAO Yibo 1．Laboratory ofMarineEcosystem andBiogeochemistry，SOA，SecondInstituteofOceanography，Hangzhou310012 2．Depa