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C015 有机分子的核磁性质计算研究
赵立峰 丁俊杰 陈冀胜
北京药物化学研究所,北京,102205
分子的核磁性质实验光谱已经成为鉴定有机化合物结构的重要工具和研究化学反应动力
学等极为重要方法,并在有机化学、生物化学、药物化学、物理化学等多门学科中得到了广
泛的应用。实验核磁光谱的测定,通常能成功地解释有机化合物错构,但对于一些较为复
杂的结构,需要借助于分子电子结构的计算预测。在最近的二十多年来,基于第一原理(量子
化学从头计算法)的核磁共振参数的计算,已经成为非常有力的科研工具。因为当遇到实验的
证据不足或解释困难时,核磁性质计算能显著地增强实验核磁技术的效用,尤其是计算的化
学位移和偶合常数在新化合物的结构鉴定、肤类化合物的构象确定、分子间和分子内氢键探
查等方面都显得非常有用。当遇到有机分子异构体之间计算的能量差别极小而不能对稳定的
异构体进行唯一的鉴定时,核磁光谱性质的计算通常能区别异构体的差别,并与实验结果配
合,对异构体的结构给出明确的鉴定和解释。
核磁性质的计算方法,刻门主要采用Hartree-Fuck(简称BF)理论和密度泛函理论(Density
FunctionTheory,简称DFT),并对两者的计算结果进行比较。密度泛函理论是最近几年在理
论有机化学最重要的研究成果之一,被认为是对标准BF和Post-HF从头计算(abinitio)方法
和技术的计算能力的最重要的补充和加强,尤其是对多原子体系,DFT通常被认为是目前一
个可靠计算方法,它能显著地提供精确的分子结构、能量和性质的计算,并且其设定的概念
简单、计算时间相对经济而又实惠,尤其在大分子溶液体系中计算将会得到越来越广泛地运
用。
本文主要针对我们实验室合成的一些有机化合物,例如3一甲基一7一二乙氨基一1,4-氧氮杂蔡
-2酮等及有机磷类化合物 (PF31PC131P(CH3)3.P(OCH3)3等),采用HF/6-31gd和DFT的
B3LYP/6-311+g(2d,p)两种基组和计算方法,在P4,2.4GC1GDDR内存的微机上运用
GAUSSIAN03,对上述化合物的核磁’H谱、13C谱化学位移和偶合常数,及”1P谱进行计算。
首先对所有要计算的分子进行构象分析,寻找分子可能的最低能量构象和稳定构象,然
后,对不同的构象进行NCR性质的计算,同时与实验值进行了比较。计算结果表明,对于氢
谱化学位移计算,密度泛函B3LYP/6-311+g(2d,p)的结果优于HF/6-31gd;对于碳谱化学位移
计算,HF/6-31gd要优于密度泛函B3LYP/6-311+g(2d,p)。对于确定构象异构体差别的自旋偶
合常数的计算,密度泛函B3LYP/6-311+g(2d,p)/GIAO的计算结果与实验值非常接近,而
HF/6-31gd/GIAO方法误差很大,基本上不能用于分子偶合常数的计算.上述计算结果,对
确定合成分子NMR谱的归属和解析,非常有用。为了减少计算误差,考虑溶剂化效应对核磁
性质计算的影响,在计算中增加了溶剂化效应参数,采用连续溶剂化PCM模型。结果表明,
化学位移的计算精度比未考虑溶剂化效应的计算结果有所提高,但差别不大,而计算量却明
显增加。因此,对一般要求而言,在进行计算过程中可以不考虑溶剂化效应对计算精度的影
响。
总之,BF和DFT的两种计算方法可以互为补充,尤其时当实验的图谱解析出现困难时,
可以借助于理论计算方法进行谱图的解析和溶液中分子构象分析,最终确定分子在溶液中最
可能存在的结构与构象,对于寻找药物的可能活性构象以及探索药物与受体的相互作用机制,
都是非常有用的辅助结构确定方法。
参考文献 (略)
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