黑曲霉果胶裂解酶的生物信息分析.pdfVIP

第9卷第3期 生物信息学 Vol-9No．3 201 China ofBioinformatics 1年9月 Journal Sep．，2011 doi：10．3969／j．issn．1672-5565．2011．03．004 黑曲霉果胶裂解酶的生物信息分析 柯崇榕，杨欣伟，林晓华，吴毕莎，陈荣珠，黄建忠。 (福建师范大学工业微生物教育部工程研究中心，生命科学学院。 福建省现代发酵技术工程研究中心，福建福州350108) 摘要：用生物信息方法对果胶裂解酶(PNL)基因的核酸序列及其推导氨基酸序列的组成、亚细胞定位、疏水性／亲水性以及 二、三级结构等进行分析。结果表明，黑曲霉的PNL为具有一定亲水性的稳定酸性分泌蛋白，具有明显的信号肽，无跨膜结构 区，保守功能结构域为Pec_lyase_C。二级结构主要构成是不规则卷曲，具有以B片层结构为基础的相似三维空间结构。 关键词：黑曲霉，果胶裂解酶，pel，生物信息学 中图分类号：Q51 文献标识码：A 文章编号：1672-5565(2011)一03—192一04 Bioinformaticsof in AnalysispectinlyasesAspergillusniger KE Xin—wei，LINXiao—hua，WUBi-sha，CHEN Chong—rong，YANG Rong—zhu，HUANGJian-zhong’ ReseamhCenter (Engineering ofIndustrialMicrobiology，Ministry of啦Sciences，Engineering ofEducation，College Center Modern Research Fermentation offuj谊n Technology，啪NormalUniversity，Fuzhou350108，China) and thenucleotideandaminoacids Abstract：Analyzedpredicted composition、sub—celllocation、signal peptides andtran—membrane and of inclu- structure tertiary pectinlyases regions、hydrophobicity／hydrophilicity、secondary fromNCBIdatabase．Resultsshowsthat PNLsare of secreted dingAspergillusniger A．niger stabilityhydrophilic a clear area．ThestructuresofPNLincludea characteristic protein，withsignalpeptide，non—transmembrane