N%2b注入与γ射线处理对拟南芥诱变效应的AFLP分析.pdfVIP

距离并不适用，我们仍然使用欧式距离)，计算样本之间的两两相似程度。然后，我们借鉴了应用于图 像分割领域的归一化分割算法(NormalizedCuts)，在对其进行一定的修改后，成功的使用这种算法 对基因表达谱数据进行了聚类分析。 归一化分割算法从两个基本的问题出发：1．在没有其他先验知识的情况下，怎样才是合理的聚类； 2．是否存在高效的方法来计算这种合理的聚类。它定义合理的聚类需要优化如下两个问题：1-最小 化类间相似度；2．最大化类内相似度。事实证明，仅仅使用这两个优化条件会倾向于产生样本数非常 少的聚类。为了解决这个问题，该算法对类问的相似度进行了归一化处理，消除了样本数量的影响。 优化的目标成为：最小化类问相似度与类内相似度的比值的和。尽管这个算法在理论上能够得到合理 的聚类，但可惜的是，整个优化过程被证明是一个NP完全问题，无法在多项式时间内得到全局最优解。 在这种情况下，算法对优化问题加入了一点限制。经过一系列的数学变换，优化问题归结为对一个实 对称矩阵求特征值和特征向量的问题，并能在较短的时问内得到计算结果。 ， 归一化分割算法每次对数据集进行一次分割，得到两个聚类。对于多类问题，我们反复使用分割 算法，每次挑选类间相似度(该类与所有其他类的相似度)和类内相似度之比最大的一类来进行分割。 类分析，并画出优化目标函数值在不同类别数下的变化曲线。结果表明，聚类结果具有明显的生物学 意义。同时，目标函数值曲线在最合理的类别数上会有明显的转折，说明我们的算法能在一定程度上 自动识别未知数据的类别数。 人类遗传资源数据库的伦理问题 翟晓梅邱仁宗 (中国协和医科大学生命伦理学研究中心) 在人类基因组计划基本完成后，进入后HGP时代。在后HGP时代，各国都面临一个建立和妥善管 理人类遗传资源数据的问题。而人类遗传资源数据库的建立，就不可避免遇到一系列概念和伦理问题。 本文将集中探讨人类遗传资源数据的性质，遗传资源数据收集、储存、使用、管理中的伦理问题，以 及在建立和管理数据库中利益分享和合理回报等问题。在讨论这些问题中我们也将同时分析国际组织 对这些问题的意见。 N+注入和Y射线处理对拟南芥诱变效应的AFLP分析 张根发聂艳丽石小明 (北京师范大学生命科学学院北京100875) 离子注入技术用于作物品种的改良多年，取得许多重要成果。然而离子注入生物体诱变机理的研 89 究还很不够，不能说明离子注入诱变作用和辐射诱变的本质区别目前的研究表明，离子特别是低能离 子，有两个重要的特点区别于射线辐射：第一，离子是带电粒子；第二，注入离子很少能穿透生物体 组织，因此滞留在细胞内。也就是说低能离子对生物体的作用，除去和服射线一样通过能量作用于生 物体以外，还有电荷和质量沉寂的物理作用，以及注入离子本身参与生命活动的生物化学作用。由此 可以肯定地说，离子注入生物体的作用机理是复杂的，也是研究生明活动的重要基础，特别是认识离 子注入和y一射线处理对生物体基因组DNA诱变效应区别无疑对进一步认识离子注入生物体的相互作 用机理是有帮助的。 AFLP(amplifiedfragmentlength 来的一种新的DNA指纹技术，具有稳定性好、分辨率高、多态性强、效率高的优点，已成为基因组研 究的一个非常有用的工具。近年来，低能离子注入生物体遗传变异的研究已有很多报道，利用RAPD 技术对基因组变异及其遗传性分析研究也有一些报道，这些研究为揭示离子注入生物体的诱变机理提 供了分子生物学证据。然而，利用AFLP对离子注入和Y辐射诱变效应的异同分析比较研究还未见报道。 本文通过对低能离子注入和Y辐处理的拟南芥基因组DNA变异的差异进行了AFLP检测分析，初步研究 表明N+离子注入和y射线处理对生物体诱变作用是不同的。 实验材料为拟南芥(Arabidopslsthaliana)的干种子。在北京师范大学低能核物理研究所进行 u N+离子注入和60Co-Y射线处理。离子注入束流保持在10A以下，注入能量