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深海微生物的研究与开发
肖湘王风平丁健
(国家海洋局第三研究所中国科学院上海药物研究所上海201203)
深海的概念通常指1000米以下的海洋,占到海洋总面积的3/4,而其中深海沉积物覆盖了地球
表层的50%以上。深海及深海沉积物中的微生物生存面临高压,低温或高温、黑暗及低营养水平等
几个主要极端环境,长期以来一直被认为是一片“荒芜的沙漠”。20世纪中期,深海测量技术发现
深海洋底也有高山峻岭,全世界有8万公里长的山脊蜿蜒在各个大洋,大洋中脊的发现使人们认识
到海洋环境与陆地环境的统一性。1977年美国“阿尔文”号深潜器最早在太平洋上的加拉帕戈斯群
岛附近2500米的深海热液区发现了完全不依赖于光合作用而独立生存的独立生命体系。位于生命体
系金字塔底部的是微生物,能直接利用深海火山口喷出的硫化物、氮化物、甲烷等低分子化合物作
为食物和能源,合成各种生物大分子如蛋白质、糖等。位于金字塔上部的是一些大型生物包括长管
虫、蠕虫、蛤类、贻贝类,还有蟹类、水母、藤壶等特殊的生物群落。有人将这样五彩缤纷、生机
勃勃的海底生物世界称为海底“生命绿洲”。目前已经有几十个深海热液区生物体系被研究,这种依
靠地球内源能量支持,在深海黑暗和高温的环境下,通过化合作用生产有机质的“黑暗食物链”的发
现使人类对深海环境以及生物圈有了更进一步的了解。在目前已发现的各种极端环境中深海蕴藏着
的生物资源极为丰富,其中最主要的是深海微生物,但这些生物大部分还鲜为人知。深海环境下极
端微生物的研究不仅是目前生命科学最前沿的领域之一,也是海底深部生物圈研究和海底流体活动
研究重要的组成部分。该项研究将回答生命起源、生物进化、外太空生命探索等生命科学的重大问
题并带动包括21世纪地球科学内的其它学科领域的重大发展。2001年美国国家科学基金(NSF)在其
New
Scienceatthe Millenium”的科学发展展望报告中,将海底流体活动研究列为海洋
题为”Ocean
科学今后十年最重要、最有可能取得重大突破和科学发现的前沿研究方向之一,生命科学与海底地
球物理、地球化学等在上述研究中将占据重要地位。于2003年10月份开始的整合大洋钻探计划
(IoDP)将深部生物圈和洋底下的海洋列为该计划中三大科学课题之一。
深海深部生物圈的发现是对“生物圈”广泛范围的进一步了解。虽然海底采集沉积柱状样已经
有近八十年的历史,大规模的系统研究开始于】968年的深海钻探计划。“深海钻探(DSDE
1968—1983)”,“大洋钻探(ODE
部曲,是国际地球科学历时最长、规模最大,也是成绩最为突出的合作研究计划。大洋钻探计划ODP
以独特的视角为我们呈现出另外一个生命世界一掩埋在洋底沉积物中和地壳中的生物圈。在数千米深
海海底存在着由微小的原核生物组成,数量极大的生物群,有人估计其生物量相当全球地表生物总
量的1/10。与热液口“自养”的微生物不同,深部生物圈的原核生物依靠地层里的有机物实行“异养”。
深海大洋中生物圈的发现,让人类认识到地球生态系统的真正基础在于原核生物。正是这些原核生
物多种多样的新陈代谢过程,产生了多种多样生物地球化学效果,在此基础上建立了地球的生态系
统。
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微生物总是出现在它们能够生存的~切物理、化学、地质环境中,这似乎是一条基本规律。那
些在极端环境中生长并通常需要这种极端环境正常生长的微生物被统称为极端微生物。极端环境涵
盖了物理极端环境(如温度、辐射、压力、磁场、空间、时间等)、化学极端(如干燥、盐度、酸
碱度、重金属浓度、氧化还原电位等)和生物极端(如营养、种群密度、生物链因素等),海底被
深海环境下极端生物特征的研究也为生命极限的研究提供了良好的生物材料并对外太空生命探索不
断提供新的线索和依据。科学家们设想:既然在如此严酷的极端环境下微生物还能很好地生存,那
么在火星上也会有生命存在。
蛋白(OmpH)。1990年日本三菱重工和三洋公司开始为日本海洋科学技术中心研制深海微生物高温/
高压培养系统,1994年才完成,耗资7亿五千万日元。该系统的建设和深潜、采样系统的建设极大
andKato
地推动了深海生物圈的研究进步。1995年Kato等分析了一个压力调控基
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