生物信息学现状及我国海洋生物信息学应用展望.pdfVIP

!研究综述 研究综述 #$% ! #$% 生物信息学现状及我国海洋生物信息学应用展望 !#$% ’ ())*’+,#)-% #*. )% #//0)-#)* ,#+)*1 ()023 ( 董 波 ，相建海 （ 中国科学院海洋研究所，青岛 ； 中国科学院研究生院，北京 ） ) **#+ ) ###,- 中图分类号： ； 文献标识码： 文章编号： 1 2 .,, .+% ) ’, / ### 0 ,#-* ##$ # 0 ##’ 0 #’ 生物信息学的产生背景 人。另外，生物学数据的积累并不仅仅表现在GH/ 序 列方面，与其同步的还有蛋白质的一级结构，即氨基 世纪是生命科学的世纪，人类在对客观世界 酸序列的增长。截止 年 月，蛋白质序列数据库 ##, , 改造的同时，对自身的认识和改造的愿望越来越迫 中存放了 种生物的 万多个序列， OQ8AA 0 RST + %#+ 切。研究的水平已经不满足在细胞水平上，而是希望 并有,% ### 多种以不同的分辨率测定的蛋白质空间 在更深层次上对自身的机理和种种疾病进行研究。 结构。目前，全球建立的生物数据及在此基础上派生、 -’, 年，沃森和克里克建立了GH/ 双螺旋结构，并于 整理出来的数据库已达 余个。这一切构成了一个 ’## 月 日，在《自然》杂志发表了文章“核酸的分子结 $ ’ 生物学数据的海洋。这些海量数据的急速积累，在人 I J 构———脱氧核糖核酸的一个结构模型” 。GH/ 双螺 类科学研究历史中是空前的。然而，数据并不等于信 旋结构模型的建立，标志着人类在揭示生命遗传奥秘 息和知识，数据的积累也不等于知识的增长，但它却 方面迈出了具有里程碑意义的一步 并为人类认识 ( 是信息和知识的源泉，关键在于如何从中挖掘它们。 自身提供了可能。-%* 年GK9?LCCI J 提出了“人类基 这就要求人们迅速提升对数据搜集、管理、处理、分 因组”计划， 年美国投资 亿美元正式启动了这 --# ,# 析、释读的能力。这其中的一系列处理过程，需要依靠 一计划。至 年 月 日，被誉为生命“阿波罗登 ### * * 信息科学、数学和具有强大数据处理功能的计算机技 月计划”的人类基因组计划，经过美、英、日、法、德和 术。目前随着计算机储存数量和数字处理速度飞速增 中国科学家的艰苦努力，约 亿碱基对的测序已经 ,# 长，使处理“海量”的基因组和蛋白组研究产出的数据 完成，这是人类科学史上一个里程碑式的事件。##, 及相关的大量生物信息成为可能，并在此基础上直接 年 月 日，人类基因组计划项目负责人弗朗西斯 $ $