第二节 核酸的分子结构和性质.doc

第二节 核酸的分子结构和性质 一、核酸的化学结构 核酸分子是由核苷酸单体通过3′，5′–磷酸二酯键聚合而成的多核苷酸长链。核苷酸单体之间是通过脱水缩合而成为聚合物的，这点与蛋白质的肽链形成很相似。 对每类核酸来说，它的核苷酸种类基本是四种，但由于DNA、RNA都是大分子，各种核酸中的核苷酸少到70多个，多到几千万个，而且多是按照一定的排列顺序相连而成，因此，核酸的种类很多，它和蛋白质一样，有一定的化学结构和空间结构。 （一）、DNA的结构 1、DNA的一级结构 DNA的一级结构是指四种脱氧核苷酸在分子中的连接方式和排列顺序。四种核苷酸或脱氧核苷酸按照一定的排列顺序以3’，5’磷酸二酯键相连形成的多聚核苷酸链或脱氧核苷酸, 称为核苷酸序列(也称为碱基序列)。DNA没有侧链。下图左侧表示DNA多核苷酸链的一个小片断。 书写多核苷酸链时，通常将5′端写在左边，3′端写在右边。但在书写一条互补的双链DNA时，由于两条链是反向平行的，因此每条链的末端必须注明5′或3′。通常核苷酸链可用下图右侧的简式表示。 DNA中多核苷酸链的一个小片断及缩写符号 (a)DNA中多核苷酸链的一个小片断 (b)为线条式缩写 (c)为文字缩写 核苷酸的种类虽不多，但可因核苷酸的数目、比例和序列的不同构成多种结构不同的核酸。 用简写式表示核酸的一级结构时，用p表示磷酸基团，当它放在核苷符号的左侧时，表示磷酸与糖环的5ˊ-羟基结合，右侧表示与3ˊ-羟基结合，如pApCpGpUOH，若进一步简化，还可将核苷酸链中的p省略，或在核苷酸之前加小点，则变为pACGUOH或pA·C·G·UOH。上述简写式中的p亦可省去，用连字符代替，如A-C-G-U，或将连字符也省去，写成ACGU。 各种简化式的读向是从左到右，所表示的碱基序列是从5ˊ到3ˊ核苷酸之间的连接键是3ˊ5ˊ-磷酸二酯键；如欲表示他种结构，应注明，如双链核酸的两条链为反向平行，同时描述两条链的结构时必须注明每条链的走向。 2、DNA的双螺旋二级结构 双螺旋结构模型的主要特点： （1）（2）））））DNA的三级结构——超螺旋结构 DNA三级结构是指DNA链进一步扭曲盘旋形成超螺旋结构。生物体内有些DNA是以双链环状DNA形式存在，如有些病毒DNA，某些噬菌体DNA，细菌染色体与细菌中质粒DNA，真核细胞中的线粒体DNA、叶绿体DNA都是环状的。环状DNA分子可以是共价闭合环，即环上没有缺口，也可以是缺口环，环上有一个或多个缺口。在DNA双螺旋结构基础上，共价闭合环DNA（covalently close circular DNA）可以进一步扭曲形成超螺旋形。根据螺旋的方向可分为正超螺旋和负超螺旋。正超螺旋使双螺旋结构更紧密，双螺旋圈数增加，而负超螺旋可以减少双螺旋的圈数。几乎所有天然DNA中都存在负超螺旋结构。 DNA的四级结构——DNA与蛋白质形成复合物在真核生物中其基因组DNA要比原核生物大得多，如原核生物大肠杆菌的DNA约为4.7×103kb，而人的基因组DNA约为3×106 kb，因此真核生物基因组DNA通常与蛋白质结合，经过多层次反复折叠，压缩近10 000倍后，以染色体形式存在于平均直径为5μm的细胞核中。线性双螺旋DNA折叠的第一层次是形成核小体。犹如一串念珠, 核小体由直径为11nm×5.5nm的组蛋白核心和盘绕在核心上的DNA构成。核心由组蛋白H2A、H2B、H3和H4各2分子组成，为八聚体，146 bp长的 DNA以左手螺旋盘绕在组蛋白的核心1.75圈，形成核小体的核心颗粒，各核心颗粒间有一个连接区，约有60 bp双螺旋DNA和1个分子组蛋白H1构成。平均每个核小体重复单位约占DNA 200 bp。DNA组装成核小体其长度约缩短7倍。在此基础上核小体又进一步盘绕折叠，最后形成染色体。 绝大部分RNA分子都是线状单链，但是RNA分子的某些区域可自身回折进行碱基互补配对，形成局部双螺旋。在RNA局部双螺旋中A与U配对、G与C配对，除此以外，还存在非标准配对，如G与U配对。而非互补区则膨胀形成凸出或者环，这种短的双螺旋区域和环称为发夹结构。发夹结构是RNA中最普通的二级结构形式二级结构进一步折叠形成三级结构，RNA只有在具有三级结构时才能成为有活性的分子。RNA也能与蛋白质形成核蛋白复合物，RNA的四级结构是RNA与蛋白质的相互作用。 tRNA的结构三叶草配对碱基形成局部双螺旋而构成臂，不配对的单链部分则形成环。三叶草型结构由4臂4环组成。氨基酸臂由7对碱基组成，双螺旋区的3’末端为一个4个碱基的单链区-NCCA-OH 3’，腺苷酸残基的羟基可与氨基酸α羧基结合而携带氨基酸。二氢尿嘧啶环以含有2个稀有碱基二氢尿嘧啶（DHU）而得名，不同tRNA其大小并不恒定，在8-14个碱基之间变动，二氢